Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.21938 |
|---|---|
| Locus | scaf14651 : 20036 ... 23773 : + |
| To GenomeBrowser | scaf14651:20036..23773 |
| Genes list of scaffold | scaf14651 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| 40s ribosomal protein s13 | GO:0003729 GO:0003735 GO:0005730 GO:0005925 GO:0006412 GO:0016020 GO:0022627 GO:0033119 GO:0070062 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.21938.t1 | gi|662189307|ref|XP_008467374.1| | PREDICTED: 40S ribosomal protein S13-like [Diaphorina citri] | 2.0e-30 |
| aug_v2a.21938.t1 | gi|663070967|ref|NP_001284618.1| | 40S ribosomal protein S13 [Diaphorina citri] | 2.0e-29 |
| aug_v2a.21938.t1 | gi|340377967|ref|XP_003387500.1| | PREDICTED: 40S ribosomal protein S13 [Amphimedon queenslandica] | 2.0e-29 |
| aug_v2a.21938.t1 | gi|148298648|ref|NP_001091754.1| | ribosomal protein S13 [Bombyx mori] | 2.0e-29 |
| aug_v2a.21938.t1 | gi|156363457|ref|XP_001626060.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 2.0e-29 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.21938.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.21938.t1 aaatcccttatagaactgtgggaaattagaattttcaaccacgtgaaccctcttttctcgccgccatcttggaatattat tggtaacgagtacttgctacaaaaactttcaaaatgggtcgtatgcacgctccagggtaagaatattttaaataatcctg gtcaattaacacttagacttctgtttggacagaggagaaacttgtttcttttttttcatcgtctgattatatgtggtttt tcttaacctttgagctcgttcgttactagaggttactagcaaggtttacggtcatttagttccacggtgttttcgttctc ccaaaaccaagagttatttcactccatatttggataaaacaaagtgtcctctaaccaaatatcaggttccgagcgaaaca atttatgcctggaacgaaatgaccttagaacgaatcgactggataccacaaacactatacaaaaattaccttttttcttg aaggaaaggtatttctgcttcagctttgccgtaccgccgaagtgtcccgacggtgagagatttatttattcgttgagttt tgtttcaaattacaagctttcattaatttgtgttggactagtacaccatgagacacactctgttttctgtaaagggcaac tgaaagcattttccattgttgggggtaattttctattgtgactcgtagtacagagatgtgtgctatacttattcatcagc atggaatttattggtcaggtttctgtagtgaattaaatgcagtcgcaggtgactgggactgttgtaagcttctcggaaac catttgaaagctaccacgattctcagtgtactagagacaaaaattttatgttgtttttggggtttgaacttgtaagcaaa caaaccacctttttctcaatcacccagtgtgggatggacaatattattatgaatgtgtaatttcttcctttagcgctctt attttatgttattttatgaacacagggtattgattgaaaaagtcattttgttaaactggccgtgctttaaattgatccat gttataaactcgctgttatttagtggctcaagttgacgtcagatgatgttaaagaacaaatatacaaattagccaagaag ggcctgacaccatcacagataggtatttgtactgaatttattacagattatacaactttggttcttacaatacagcattc atttcttcagcctttttgagattccgtacttcttaaaagtacatttaaaccataccagactggataaataactattccgt tgaatttgaggactttatcccttaactttggtaattgttagtgtcatagtcatgattggaattgtaaagtaaccttataa aaatgaaaccttggagtgagagaaattatttagaaaagctttattttctcctgatttatgatgctattgatatagtcaag actgtgctttacaacttaaaaaacaaaagctatatggatgctagtcaataattattattatgattctgatttcctcaaag tttgtaagcacttttttgactcagtagctctcaaaaaagaagccctttgtcatcataacctcaaaagctgcatgtttccc caagaaatagttaaaagacgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactggttctgatggtgtgtttgtaccttgtcttaatcag ggttagcgggaaatcttcctgaagatctctatttccttatcaagaaggcagtttctgttcgaaaacatcttgaaaagcac aggaaggtgggtttgtccagtcaatcacctcttatgtctagcctgcagtgttctatacctctataccatgtgtaatacta tattatccatggattcgtcacactgttacactgttggcactttgacctttcacttgtagatcagatgaatggggctccag gctgctcatgcatatggccaaccataattttgagtccctttacccttcttacctgtctcacatttagaaaacataagtac ttttctatgctgggacttctttagaagtcctttgtcagttgagatgagttatattgaattgtgcttttgtccaggacaag gattccaagttcaggcttatcctcattgagagcaggattcatcgcttggcccgttactacaagaccaaaagacttttgcc tccaaactggaaatagtatgtcaatattttattgctataataatttttttcaaaattg |
|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.21938.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.21938.t1 MKPWRLAGNLPEDLYFLIKKAVSVRKHLEKHRKDKDSKFRLILIESRIHRLARYYKTKRLLPPNWK* |
|