Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.02107 |
|---|---|
| Locus | scaf704 : 168428 ... 172795 : - |
| To GenomeBrowser | scaf704:168428..172795 |
| Genes list of scaffold | scaf704 |
Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.02107.t1 | gi|260825542|ref|XP_002607725.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_114714 [Branchiostoma floridae] | 7.00005e-41 |
| aug_v2a.02107.t1 | gi|585681319|ref|XP_006819848.1| | PREDICTED: nucleoporin Nup37-like, partial [Saccoglossus kowalevskii] | 3.0e-36 |
| aug_v2a.02107.t1 | gi|156388825|ref|XP_001634693.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 4.0e-36 |
| aug_v2a.02107.t1 | gi|390359180|ref|XP_792262.3| | PREDICTED: nucleoporin Nup37 [Strongylocentrotus purpuratus] | 1.0e-29 |
| aug_v2a.02107.t1 | gi|705671238|ref|XP_010115139.1| | PREDICTED: nucleoporin Nup37-like [Chlamydotis macqueenii] | 4.0e-29 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.02107.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.02107.t1 atggttaatgaaattttttaagtcaacagaagctgaatcatgccatcactggctcttaatcaagaggaatccagcacatt tcactttgacagtgtggaagatgtaaaagttgtggagttttgtccatttgcacgtgctgctggcctcgttggttatgggg gtgagaacagagtgtcaattggcatttgtttgtttcaagaagaagcatcagaaagccaccttcctgccttacagttccag cacgtaacagattttcatcatggaacaaatgtgctctctcttgcttggtctccaaaaacaaacattcaacacttgccata ttctttacagtgagttgttaaaaatgtgaacaaaacaaaaacatgttgatggcagggttaactaaccttaaatgctaacc atgtcatatctgcccaactgaactcagtcagacactccatggtggaagtcttgaaatgggtgatacaaggaacctgatca cattctccgtgatgtttcacagtaacttctttcttgcaaatgatatgataaaaggcaggcaaattaccatgaacttgatg aagaaatgttttatattttgtcgtccattctttctaaaaagtcaatctatattgagcagcaccagcaaattttctggaga aagactaagaagttgttgagagggtcaattgaagtttattttctgcttcggattcacttaattctgtttcagtttctgcc atcatttctgtactgtctgccatttagtaatttttgtcatattcttgtcccagaccatggatttgcacaaatgtgtgaga ttctcatgagcatgtgtgacagtgtgagataattcctgagtgtgtgagtctcacgcgagatcctcaatatgtaactccca gattgtgcctccctgagaccagatccctgaccaatcatatcattggaaagttaaatctttgccatataaacaacccttct cttatagagaccctccctgtctaattggtcattcactggagctaactctaaaacttaaggaccagttaattatcatgaaa aagcacttttaccaatgcattaggggtggtaggttgtgtctctgtgactatcaagggatgagttagagaatcattctttg atattttccttcttgacttgtatcaattattctactcttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataagttatttggcac ctcttaaaacggtttttgtgttatttgcctattaatttcaatcatttcaaaacagttaatagttgcttctaatttgttta gagaagccagaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaatgatatgcacaaataattttagcttttgaagtga ctgcagtgacattctcccattttgtgcaggtttggtatggctggcgaggataataagattcgttactttgtgtctgatgc cagaaattcatcttcagtgataattcttgaaggacatctcaattatatcaatgactgcatcattgaaccagtgtcgggca tggaagttgcaagtgtcagtggtaatgttcttaaatttacatgttaattatgtaaattatgtcttttatactttttctta ttattcctttagccatctataatttgtaaataattctaatactcacaggaagaaaaattgtttagttttgatccatatca ctttttttagtaccattttatattgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnntagatttaggtgatgtatttttgtgtgttctctaaactctgcaatatttttcattgtacatgaagcaggtg ttatctaaattcatttgttggaagtcattgcaaaatttatgtctttccacagtgctagttgcacaaggtggaattattac agagaagtctttttataaatattattgttattcgttttttaacagccctggaaagacaaattatttattttatttgatgc aaattatttcgttactttcttgctttaggtggtcaaatgttcaggacagtctatttgccacaactggtcgtccagggaac catgttagcatttatcacatggatcatcacaaggttagctatttttgtaaataccaggtcttcaaatttggaatgattat aatagctgtctccactctggcatagtaacaaataaatcataatttcttttattcctcttgccatccattgctctgaaatg cctttacttctggtccatgattaaaatagtgttaatggccaggttaagcaggacacaataataattattgcttgttcaat tctatagcttggagttgatctattatgaaaaagtcaatcatgtccttacctcactctttcagttatacatataatccaag attttttcattgtatgtgaataagatattgtgaactcttaagttcacaaacatatcactgaaaaatccatcagatgcatt ccctctgatgcgagacaacatcaacagaataagtggaagagttgtaccggtaaatatggttgcctttctttattattcca gataccagtttcatgtcaaatgtcaacaggaggtggactgtcatggcatccatctttaccaatatgtgcatctggtgggg ggaacaaggtgcacttatggtttgtggaagtgtagtttttgaaatggatgttgacaagtcagggaaggaaacaaaattat ttgcactaatgaatcaagtcaacctcttacagacatgactgtacaaatgctgcaaaaaaattttaggacaggaaaaaaga gaaaagttaattcaagaccttagttgtgaagaaagttgggaattggtg |
|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.02107.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.02107.t1 MPSLALNQEESSTFHFDSVEDVKVVEFCPFARAAGLVGYGGENRVSIGICLFQEEASESHLPALQFQHVTDFHHGTNVLS LAWSPKTNIQHLPYSLQFGMAGEDNKIRYFVSDARNSSSVIILEGHLNYINDCIIEPVSGMEVASVSGGQMFRTVYLPQL VVQGTMLAFITWIITRYQFHVKCQQEVDCHGIHLYQYVHLVGGTRCTYGLWKCSF* |
|