Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.21670
Locus scaf14286 : 9606 ... 19281 : +
To GenomeBrowser scaf14286:9606..19281
Genes list of scaffold scaf14286

Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation GO
ammonium transporter 1-like GO:0008519 GO:0016021 GO:0072488

Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.21670.t1 gi|156406997|ref|XP_001641331.1| predicted protein [Nematostella vectensis] 2.0e-11
aug_v2a.21670.t1 gi|260830862|ref|XP_002610379.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_72413 [Branchiostoma floridae] 4.0e-11
aug_v2a.21670.t1 gi|72171193|ref|XP_781954.1| PREDICTED: putative ammonium transporter 1 isoform X1 [Strongylocentrotus purpuratus] 9.0e-11
aug_v2a.21670.t1 gi|269785089|ref|NP_001161500.1| ammonium transporter-like protein [Saccoglossus kowalevskii] 4.0e-10
aug_v2a.21670.t1 gi|156378092|ref|XP_001630978.1| predicted protein [Nematostella vectensis] 4.0e-09

Transcript
Transcript IDaug_v2a.21670.t1
Definition-
>aug_v2a.21670.t1
ggaattcaaacaaaaactggaaggcgagatggcctctgaaagtggtgtgtccgagatggcgtttgaggatcttcgttcta
cggtaacagttctccacgccaacctcgaccaagcttttttaatattcatgggctgcctcatattttgtgagtactttttt
tatttctttaacacatctagtcgaacatattcaacgttttcattgagatgaagtgaattttatccacataaataatttct
tcactccggtaactttatcacactcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaatggtcatgcacaaattttattttcagtgtatgtgatggtcgtttccgaac
atctccgtagccttacttgctagtttacaattggttttcgcccacaaactttcattaggcctacgtgtctggaattttgc
cccttcaaaaaaaaaactatcatggagtggttacgacgcctgagagactcctatactcgataagaaccttttgtttctaa
tccaattcaaccttaagcccagcatcgctcagaaattccagccagtggagattagggtaggtattaccttgtaaaacttc
gtttgttttttttccaagattctgatcttaaatacacaattaaaggctgtacccctctagtataagcaattaaaagagtg
aaaatatagtgacttctgacgtaaatcaacatgaatacaaacaagcgtaaaagtacgacaaaatggcaagcgccactttt
cggttacactcttcaaatcaatcagatttcttcaagtgctacgtcattggttgagtctgtgaaatgactcatcagaaaaa
ccaaatactttaagaaactaagattttatttgtattaagcaagcaagtagcactctttcagttttcaggtaatcaacgaa
ataggcttcattcctacgagagatacttgtgcgaccttacaggaacactaaatttgggacaatgaatgaatctatgcata
tttttctgattgttgtgaaaaaggcattttgggatcgatgacaaagttacctactcagtttagttacttaaacaatgatg
aaacttctagaaaagagcatacattatttaagtgaacttcacagtaactgccattcgcttgctattttaaacacattgcc
cggggattgagaatctcagtggtccttcctctaagacatttattatttattatttgaagcataaggaaaatgcactctat
agaaaacaaatcttatttactacttttaaaattagataacgcttgtgccttttagatttcatttagatatttgtttgtct
cttttttctgccataaacactaaatggcgtgtcgttggctggccactcatgcatgattcggctattttaattgtgaaatt
aattacttcgttcgctgaccacatgtgaagtaaaggaatgatcaacactaaaacgtgatgaaacatgctttcgattacaa
acgacccggaacgcgaccacgcactgagcttgttagtcagtttgaaaggtctttctacagtgcactttattttgaaaaat
gtcgcttttcaatcaggtagcggaatttgaaggattttttttatggagatttttatgggggcaaagtcaacatgtgaatg
gggcttttaagttttagccgcttccgttctgcagcagttacttttatattcagaaatcaaaggagccactcataaatttc
ctttgattactgctaaaaaaagcaattacaaacgtgtttatgtcggtgggaaagcagtttgcgtttagaggtggggtgct
ttccattataccaaagattccggaaatttcggtcggaattcaaatggaaaggtccgtttcggtttcttccgaccggaata
ttcgggatcacctctggaggtggtccacttatttcggttggaatattccgatcgaaattcgccgttccatttttggcaaa
ccggttctttgccctaattagggaattcggaaataataaacagtggcaagagctattcctattggttggcgcggtttaat
cggaaaatgttccattttccttgggtagtcccacttatctctgaccggtcggtttggcataatggaaagcaaccgtggta
aaagcttcccggttgaatgctattttcttgaaaggcaatttagctttctcttggggcgacgaaatggttcatacttgcta
cctcggagcactttattatttaacatgaaacaactttgaagttacgcgctttccgattggtcaaaaacctatgggttatt
gtggctgtaaactctttttaaaaaaatggctgctccttacaataattatcgttttattaaaaatcgaccacattttcaat
aggtttaccgatgtcctaaacccacttgggtttatgcggcctccgcctcatgatttacaaacttttctcttattttccca
acatcccaagtgggtttatgacgccagtaaacccatagaaaatgtggtcaattgcttaaccagtcggnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgagaatcactc
aaaagttgaaaagctgaaatgctacttgagcacttttgcgtccttaaatgaacagatgccctctgaaaattagtttgtct
taaacttgataaactaacgaggccttctagtcagaaataattcgtgtgtgtatagttcatcagtgacacatttatgaggt
gccaaaaaaaaatgccggtggcaaaaacaaacagtgagccttggagccttggcgttttcagattcctcgtatttcagcag
aaaaaaaggctgacttaacgaggttggttcacatataggccagttcggaaaataccataatactctttgtttgtcccccc
aaattttgcataaccattgtttttgttttctctggggaccattataagtcccaagagaaactggaaacaattcttatgca
aaatttgggaggacaaacaaagagtaatatggtattttccgaactggcctattgttcgcatcttaaggagtttcccgtcc
ttttcagtaaccttacccttctcgtctgaaatgtagaatctacaatctgtttcactcacactcagaaaacacttcatcta
atctcgtgtttttgatttacagtcatgcaaacgggatttgcatttctggaggccggatcagtaagatcaaagaacacaac
aaatatcctcataaaaaatgtattggatgtctgtaagtattcaaaatttggttaaagatttgatcttctgttttctcttt
tgaatgtagaaatgatctcattcctaaagaacgagtacattgctgaaatgataaaataacttagatgacagtttgctgac
gtaaaaagagtttttaatgtttaaagaaaaaaagaggaatcgcatcgctgagcaacgtagaattcagggccactcaatta
acatataggaaccactcattattcaaagcagaggagaacaaccaacagtaacggtaaaatacaaagtaaattagttggta
aagcaatggcagctgttaactttcttttatcagcgaattgaaaagcacattagtgctgaaactctccggctgcatcgtcc
attgcaaactcaaaggttacaattctcataaaccaagcacaaaccagtgtttcattttgaatnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagaaaacaatacaaacctgaacataagtggaaaactcgctcaagaaaagtcatc
atctttcgtcgttttgttgaacttcaaagaggagagaacttatgctaagaatatataagagaagatacatgtctttctct
aagaatttgtttgcctcgatctgatctgattggctcgactggatcgaatctgtcaagttctcattggtaccaacttgatt
gaggcagggcttagactaagtgttgcagccatattaattaagctcactcatttagccaacgttgctgacaatacatttat
atttcctatgtacccacagttcatcttggtggtggaatctggggagtgctgtctgttcccatcttcaacaaggaatctgg
tatactgtacactggaagtctgctcgctttccgtggtttcggttggaatattctcggtgtgctcgctatcatggcgtggt
cagcttctcttgcatttctgttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcattattttgcatcttgccaagctactccg
agttcccgaggaaattgaattgaaaggtgggatacagtatcaatcacgctaataaggacctttagattccatgacgagga
caagaactagtacgagatttgactgcccgtttttagagaaaatacttagaaaatttttaacccggacgattaatcttact
ctttgttagaaatactgtataagttgatctgctattcttattgccgggaacggaacctttttgctgatcgaaaaatgcca
aaactgcgtgctaccgtgttcttgacttgttttgacaccacaacatttttgcaaaacctcgtactaaaatgacgacggtc
tcactttttatcccgccaaaatgatgttggtttgcgcacgctcaatgttgttctatgagaaaatctcgtactcgtcgtcg
ttcttgtcctagaatctaaagttctctaatatcaaataaggcagcgaacgttgtcaaatcaacacacttccgtacgtgct
cgtttgtgtatacgtcagaaattacctttaagacttacaaaggataaaactcaatacttttttgagggatgcaagaccgc
aagtcgtcaccaatagaccgtattcataaatggcagcttagtaatcattcttttgtctttatgctgatcatcctaactag
cctcgttagcacgaacaaaattcaaaagaatttttgcttgaaagtgaggctagtgaggatagttaacctaaggacaaaag
aataatttcttcgccgccatttatgaatacggtgtaaggcaggtcgatgtgcaaaatatggcctttaaaactcatgcaag
acgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgtaacggagatgcag
gtgattccgttgtgagtggcaataccacaaacacacacagacacataacagaaaagacttatttctaacctataagctcc
gcaatttccttgataaaaaacacctcaacttacatatttttttgtgttaaggtcttgacatccccaagcacggtgagccc
gcgtatccactggacagttatggtgatggttggtccgcagattctttatcagcccagccactcccttacatacacaaatc
aacttctcacctcaacatcgccccggttaatggtcacaaccagatttccccaaatggcaaaggagttgctaatcagggtg
tgatcgtggtggaaaatcccgctgtagtgccggagaataatacaacagcgttctaaggaatgttttgtcaaccctggaat
aatgactgagttaaaactgatgcaaatgaaagacgaaacgtaataatattttattttcactcagggagaatgtttttctt
gaaattctcaatatatgcgatgtgctaatcttatgcttatgcactttggattcaatgctactctaaaagtcagccttata
ttcctgtcgttgcaagactcaatagaaggatcattacagattgtacaaagtgaagaagtcctaacagaggttattttctt
gttttgaaagggttgttgcattttcacttgcgtaaccactatttcattgagcagtgagtaaaactctgctcattta

Protein
Protein IDaug_v2a.21670.t1
Definition-
>aug_v2a.21670.t1
MQTGFAFLEAGSVRSKNTTNILIKNVLDVCNSSWWWNLGSAVCSHLQQGIWYTVHWKSARFPWFRLEYSRCARYHGVLLR
VPEEIELKGLDIPKHGEPAYPLDSYGDGWSADSLSAQPLPYIHKSTSHLNIAPVNGHNQISPNGKGVANQGVIVVENPAV
VPENNTTAF*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495