Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.20613 |
|---|---|
| Locus | scaf12924 : 32416 ... 50750 : + |
| To GenomeBrowser | scaf12924:32416..50750 |
| Genes list of scaffold | scaf12924 |
Manual annotation
| Study field | Cell Cycle |
|---|---|
| Gene name | Adi-cyclin A1 |
| Description | Named thus because this protein shows similarity with Homo sapiens cyclin A1 by the BLASTP search. See Homo sapiens cyclin A (P78396). |
| mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| g2 mitotic-specific cyclin-a-like isoform x3 | GO:0000079 GO:0005634 GO:0019901 GO:0051301 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.20613.t1 | gi|156375154|ref|XP_001629947.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
| aug_v2a.20613.t1 | gi|585687544|ref|XP_006820511.1| | PREDICTED: G2/mitotic-specific cyclin-A-like isoform X3 [Saccoglossus kowalevskii] | 0.0 |
| aug_v2a.20613.t1 | gi|585687537|ref|XP_006820510.1| | PREDICTED: G2/mitotic-specific cyclin-A-like isoform X2 [Saccoglossus kowalevskii] | 0.0 |
| aug_v2a.20613.t1 | gi|291236244|ref|XP_002738046.1| | PREDICTED: G2/mitotic-specific cyclin-A-like isoform X1 [Saccoglossus kowalevskii] | 0.0 |
| aug_v2a.20613.t1 | gi|676435260|ref|XP_009047499.1| | hypothetical protein LOTGIDRAFT_225111 [Lottia gigantea] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.20613.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.20613.t1 cgagtccaccgcaatttttttaagaacataaacatggtgccttgaaggaggtgtgctgatggttatagctcttattctcg cctttttgatcggagtattttctgttttgcttctcgagggcatttttctttacaaatggtggacatcaaagccagaagat gaccgaaaactgtaccccaaacgcacgaaagtcaccaaccccaaggtaaatagattgtgcaacctcagatttttcagttt tgtttatattattttttggcaaaggaacttaacggtctttggcgtcattagcctttgcaatcatgatattttgatcacag aatatccaaccacttctaaattaacttcgtttttttcctgtgaaactatgccactggtagtgattaatctgcataatttt tttcttttccattcttcttacataatttcatgctttcttacgaggttcacgtatcggtgtggaaattatgtataacttac cattttccaatcctgcaacgaaaagtctcttttttcaaggcatctgaaaactaaggttttagagttttgctggaaggcat ttccgtaaatgtcaagtgcgtatcatattttccatactcctctttattttctgacttctctttaatttctgagaataacg tgtaaaaaatgacggtccaaattcttttagaagacaaaacttaccaataagaatttgatgtaggtatttgtctttgacat aaataattattgatcgtctgcctgtagcatttttattttcatttgttcttgttatttgagagtatttgatgggtaaccaa aaagcagcattagtcttgctttacaaacaacaactgaggttgcacctaccatgccacaacgctttaatagctttgctatg acctttttgtgaattactcaccctaatgcaactgctctcatcttcagttcattgcagactatatcatgaaagatggtgct 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nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttctacacatccgtggtctgcgtacaacctcctgtcggcactgctctcggctggagg gcattcgaaagaaatttaattcgcttttcccatgcgatcagcatctgtcatctatgcaagtattctgtgtgtttggcgga agaaaccagagtatccgttgaaagctcttgagtcacgtgtaaatcgactgaaatccaacccatatagatccgaagaggca ggagacacggttgatgaaaattatgcaaacgtgggacccctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttattaaagtgaca atggaattagttggaactaaccgtttggggacactggaaaagaaaaaagttttgatataaagacctgtctaagttaaaaa tacaactgaatatatgtatactaaaatgtaagtttatgatataagataaaaaatcacattccaacagcccagttaataat attttaaaaaaccgctttgtgctgattgtatctttcttatccttgtctgttaggtttggactaaagtagccttccagtgc agaatctgcgctatgatttgtcataagaaatgccttcaaagctgtatgagatacacgcactgtatccagtaagaatttgc gctttgtctaaggcataccaatttgtttctttgtattatcaactgataacaaggtccacaaaagaaagatcgaactctct tccttccttttgtggaatttcgctaatgaagctaaccggtgaaaggaaacgcatctgtttctttttccctgctgtaacac ccgagaaatttctgcagtttaattggctggaagaagaggtatttcatcgtaatttgaaatatcaacatgctgtctcgcgt agtccggcatataactaatggtaatgcaatttgtctgttgtgattttgaaaaatatcatccctgtggtggtagatcagag aattattacattggtggcatattcattttcgaataagaaacaactcaattcttaattattctatcagtcatgtccacctg cgcccatgccccttcctgttaactgcaaggcatttgtaggcttttctattccccggtgggcataagaaaaattgatctca tcctgagacctaagagttggaagtttgcctttcaagaaaaatgctcgggagggcatagtgtgttggcaccgctggtattg 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gtcatgcctctaaacatcctcaacaagccattagagaaaaatacaagagtgcccggtaatacatcttcttcttatcctta atagcattatttaaa |
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Protein
| Protein ID | aug_v2a.20613.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.20613.t1 MVIALILAFLIGVFSVLLLEGIFLYKWWTSKPEDDRKLYPKRTKVTNPKFIADYIMKDGASEEESCLSLNFLLAFLWREW RDSPKTKSFLLARMNSELTELIKSKAVTISRETNDISFGLTLKEVNDGEFGKTIVIQTIVTDSPAYCAGIVAKDIFLAID GRKTDSLKQAAKMIKNKNRFTATVQRPPTRLTQQLNQDVPDKELGKTVVDYKNVALDSNSESEDEFVNIVVPLFEHADRE MAKSVVQEMLLTSTDLRQQAEKKLKLKQG*DQRAIGLTSADEKQDSPRVLRKTSDQVTQDVDKKVVFPSSTNDSPAQGND QVSPPSQTAVDGPDHVKTRLVPASVEPVWSETVKFDILQGHQYLNVCIWCKFQDKNEKDALLGYISIPLMDIAWQCLALS SKRHEQCYMLDESQLKDTLESLEPPKHQFSLTQFHFPTRCSYCNKKVWTKVAFQCRICAMICHKKCLQSCMRYTHCIHET KSTPRWFSKMPPKRGKNKTKKKKRQQQDCSSAEESIAEGSSESELDRNIKKTEKCPDKEVKKQSGANDCDQTETSNEIES LVLTAFIVKMSLSLAENFLITNNFQDNQGSNALKKAKMEDGQARATQQGQKRAALGTITNNPGVRIQPFRAAKQQAGFAS SSYVISGSKNDENAFSQAQQKTAFAVATTKQSFTIHVDPQPSIATTKPKAKVQELNPALTSLSRPALTDVFVSNTPVEVE SPMIIDSSYDEDIECTTETAPEIRDIDSGDDILLVSEYASEIFQYLKQAEQKNRPKPGYMKKQSDINHSMRSILVDWLVE VAEEYKLLPQTLYLTINYIDRFLSVMSVLRGKLQLVGTACMLVASKFEEIYPPEVTEFVYITDDTYSAKQVLKMESLILK TINFDVSVPTVVNFLERFLKAAECPDSDFPRFEALAKYLCELTLIDADPYLKYLPSTIAACSVVLALHTLGLQSWNPTLC HYTGFQLLDLQPCLHSLHRTFSHASKHPQQAIREKYKSAR* |
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