Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.19625 |
|---|---|
| Locus | scaf11689 : 13316 ... 21422 : + |
| To GenomeBrowser | scaf11689:13316..21422 |
| Genes list of scaffold | scaf11689 |
Manual annotation
| Study field | Photoreceptors / Circadian |
|---|---|
| Gene name | Adi-opsin-10 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| protein | GO:0009987 GO:0044699 GO:0050896 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.19625.t1 | gi|156366198|ref|XP_001627027.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
| aug_v2a.19625.t1 | gi|156366164|ref|XP_001627010.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
| aug_v2a.19625.t1 | gi|156367150|ref|XP_001627282.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
| aug_v2a.19625.t1 | gi|156366162|ref|XP_001627009.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
| aug_v2a.19625.t1 | gi|156379986|ref|XP_001631736.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.19625.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.19625.t1 aactcgtgattcagcgcacatctacccgaaaatgctttgacaaggtcgaaagttttcttgaaacgtctcctctcagtatt ctgttgcattctcaagggaaaccaaacgaaaaaactagtgtctttcaagtcagtcaaggtaaaaagtaataagtacactt atttatttcagtcatggttaatgtaagtcgggttccctttttattatatcttagctaactctttagatgactgccagttc ttcgtttgtcgccaaaaagcgttactccgacgctacgaatagttttatttctgttgcttgggcttcaatatccgctgaat ggttctttctctggcaattccgttggctccgcgggctcctttcatataaccgcctgaccacagttacaaaagagagtcct agccctgtagtctgaggagcttgtttttaactatttctgacaatgtgagttcggtttgtggtctattttatttgttgttc aaagaaattgatctaataaaggtgtttgaggaagttgttatcgatgatttctgctacctcgacaaacgtatcatcaccaa tctgcgcatagatcacgcggtttcatgtagttgagacggcagtgatcagtgaatgacgagtattccccgacaaaccaaat atcgtcctcaaaacctgttggaaccaaagcgggcaggaccgctaatggaaaatttatcaaaataaaggtcaggcgaagtc atgcaacagctaaaaacaaaaacccgcgcacaagttcaaaacaaagccgatatgaatatttggaatgtagtacaacacgc agttctgttaattcaatatttctgttggaattcgaggagatcagtggcgttcatttgaacagggcaaactccttagaggt gtacaaaaaaaatattttaaaaaggcttttttatcactgtctctttaatgacatgtaaaattgaacgaaaattttctcct 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|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.19625.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.19625.t1 MNDVPAPFPSTTRMTTRSDDNPNSARRPQQIAFIVYVVIMTVILIVGFLGNLFTIIVLRCPEHKKKIITPLMMNLAFADI IIIVFGYPVVMASNFTEHNVLTNPMLCVWSGFINGSVGIASIANLTMMSLVMFKSLNKVGTVKKIPWKKMLAMILFTWVY GVLSMFPPLVGWNKFVPGASGISCCPDWSPDTKAAVGYNILLVFVGFVLPLTIIIFCYYRMYRFIHTQQPVTGNASIQAS RRRSEIKIVRMIALAIAAFVLSWSPYCFVSIAGTIRGSSLLTAGEAEVPDLLAKASVIYNPIVYTVMNDRFRGTLLRVIP CRRWFNGDINPTVSVSAPNSQDGNSHNFRERPQSVKGNSTV* |
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