Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.18753 |
|---|---|
| Locus | scaf10596 : 29056 ... 38740 : + |
| To GenomeBrowser | scaf10596:29056..38740 |
| Genes list of scaffold | scaf10596 |
Manual annotation
| Study field | Photoreceptors / Circadian |
|---|---|
| Gene name | Adi-dco |
| Study field | Flagellum |
|---|---|
| Gene name | Adi-casein-kinase-I-4 |
| Description | Named thus because a bi-directional best hit result was obtained by BLASTP searches. See chlamydomonas casein kinase I (EDP02935). This gene is associated with chlamydomonas sperm axoneme, but it is not clear whether it is associated with metazoan sperm. |
| mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| casein kinase i isoform epsilon | GO:0004674 GO:0005524 GO:0005634 GO:0005737 GO:0006897 GO:0008360 GO:0018105 GO:0030178 GO:0030529 GO:0032436 GO:0032922 GO:0034613 GO:0042752 GO:0044822 GO:0090263 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.18753.t1 | gi|156365823|ref|XP_001626842.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
| aug_v2a.18753.t1 | gi|658861089|ref|XP_008413307.1| | PREDICTED: casein kinase I isoform delta isoform X2 [Poecilia reticulata] | 0.0 |
| aug_v2a.18753.t1 | gi|449481829|ref|XP_002195759.2| | PREDICTED: casein kinase I isoform epsilon [Taeniopygia guttata] | 0.0 |
| aug_v2a.18753.t1 | gi|149065930|gb|EDM15803.1| | casein kinase 1, epsilon, isoform CRA_a [Rattus norvegicus] | 0.0 |
| aug_v2a.18753.t1 | gi|701298397|ref|XP_010009535.1| | PREDICTED: casein kinase I isoform delta isoform X2 [Nestor notabilis] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.18753.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.18753.t1 tgctaaacgattaaatgaagttttcccaatgacatagagcgaaacatagaggttccgcgaagatctttgtgaaatctagc catcgttcatggaagatggtgtaattaatcgtagggatcctctttattggtaaaggagttttgcatttctacgatcgact ggtatcaagcgctgggaaggagttatttgaggacatttctttcgttaatttcttcttatgactgaggagaggaacgcttg acaaactccatttggatttgtcgtgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggcgtcgtcggtaaagaaaatgtcacgatt tgaggaggtttcacccgaagaaatccagagaattgcttgaaaatttactaaaacagttattcttctcggacttgcaggat atgagctgataataaccaactcggcctacagcctcgttggttatagatatcagctcatatccggcgcggcctcgaagaat aactgtaaagtattatatttttaacaaatacccatattttaaccctaaatcttgagccttcattagagaagatgaaatgc aaaatcgaaaaaattaaagttaactcatcaaaactgaacaaaattatgccatgcaaatccttctaaagaaatgtcagtgt ttgctctctttcaacagtcaatatctgtctcttaatattcgcataggtaatagcatgatttgtagtgatatttggcataa aaaccaggagtgatatttcaaaattgttttacataatttggggcagttttgaaatatcacgagtggtatttatgccaaat attatgtacaatacatgctattacttttttatactataacctgagaaattcagtcatctaacactgtgtgtttattttcg tcaagcggttttgctttgtaggcgagcaaattggttttgaagttcttgatttcggcccagctggtccagacattgagcca ggttgatgtacttttctcagtattttggctaccaaattttctttttgttcttgaatctcctgatttcaaaatctagactg aatctttccgctatttttgtgtaactcgtgtgacaagattatttggtgattttgggctaccatagtaactgtaattttta catgtaggtatttcaaattaagctgaaatacctctgctctcagccaatcaaatggcagaaatttctcgggtagtagtata aaaataataattaatgttttacagtggaattgattttctggctcttaaactgcaacctccacagaaggaagtagatcttc actctacaagatgaaccctaatcctaaacctaaattatggcaaagagagaaaaaaaggaaacattagttgctgttgtgac tgtattggttgcaatttcaagccctccaaccaaagaattttttttttaccaacattatagagttttgttttttcttactc ttcctaagcataagaataacatacctttttattgtattttttttcttttttgttgcacagatcagcagaatagagtatgt gcattgtaaaaacttcatacatcgggacatcaaaccagacaattttttgatgggacttggaaagaagggcagtttggtgt atattattgactttggacttgccaaaaaatacagagatccacggactcatcagcacataccttatcgagaaaacaaaaat ttgactggaacagccagatatgccagtatcaatactcacttgggaattggtatgttattttattgttggctgggttcatg gcccttcttgaaatcttgtggatttttttaaggtttgtcaacctgagtgaggtttgacaggctaaaaaaaattgcttgcc atattattccatgcttgtcaaaatgataatgccagcaagtggtgtaactgctggctgcactatttcagctgctgcagact acagttcacttataacatggttcttctgctaattaaagtcctactttaataaattatatcaccaaccattccttgtaatg tgtcaagtgataaatgaatagtaatagaaatggacaacactcaaatgtgataaacattagctgaaaagaataaagttccc ttaggattatgcataattaaaataattattctgtgttgcacagataccagttttacctgaattgtgtccaactgcacata gagagatggtgtgaactctctaattagtgagattcgtcacttacttatccatgcacttctaaaggatggaagctattgag attttcaaggacaatgcagtgtaaaataaagattgtttgccagtagatgactacttatgttaatgaaaggggcttgttta tgacactaataactaaccctgtagctctaaacattcattcccttatcacattgttttatgctttttccacaaacattact ttcagatgtatttttctgttacagaacaaagtagaagagatgatttggaatcacttggttatgttctcatgtactttaac ctgggaagtcttccctggcaaggtctcaaggctgccacaaagaaacagaagtatgaaaggataagtgaaaagaaaatgtc cacaccaattgaagtcctttgcaaagggtttccatgtaagtgacaatgaaactgacaacaaatgaggtggctgaaattag tttttgcagtgtctgtgttgagctctacaccacaataattattgctaatacgtatttatttgtattagcataacgaagcc taaactcagactttgggaacctgttttcataaccccaaacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn aaggtgtcattaacaacagtcacgcgaatgaagctaccagatgctatcaagtgacgtgctcataatttgttttgtctttg tacatcgccttcgatacaaactatttgacaaatgtatcaaaccttgagaattaccattgctcttcttgaaagaaaaaaaa caaatccaagatctctgcagtgaccttgattttcaaggacaaaccacagcatcgggaactccgtacccttctgtttacga atagcgtgtgggttctttaacgtcccacagagttgagattcgaaagaattgtgagacgggacctcaggtttatagtcctt aagaaaactataaaaaccattaaaaaaaagaacgtctaaccattcgcatgtgtagggacaaaggcagcacttacttccca gttacttttaagacctcgagtggtggtccagcggtgatatctaaccccagcttcctgcgcgaaaatcttgtgctgagcca ctgagcctcagatagggtcttacactcactcactcacttactcagacagccccgatgacatagtgcattacaggttagcc cgtaaggaaaaaaaatgagagtgtagtttacaataaacaaaaacaaacacaatgagggaaaacacattcaatacatccag aggcttttgtatgtgatggaagatcactttcgatttctcattatgactttctgtaacgttacttagcttactgtagctat gacacacttattgataaatttttttgttttattttaagaagtgaagggaaggatgcatgttaagatagttgcactggaag ataacttgtttacctagtaataaaatatgattaattaactgcatttctttaccaaagagcccaacattttgcttgtctgt caaaatgggaattgtagggaagtagttttcaaccattcagctacaggaagctaaaaagtacttgatattggaccatggat aaatataattatggttgagggattcctctgatatttgacaaaaagtacacaaatgtgaatggaccattcctattttatag agagctttatttgcatgaaggattctgtttaggacgttaaattcttaatactgaaattctctcatgtttgagtctaaagc acacttcaaaaaaggagaaaaatgtctttctcaagtaagacgtgatgaaaaatactgtttgtatttaaattttgaagttg gaggtttcttaattttcttgattagttctcaaaataagtttcagagcatgctgggaaaatagaatctactgttcatgggt ctcaggcaaattgtttggcatatcccttaaaagatcttcctccatggtttcatttgactaaaatcagtaagtagatcatt tacagagcgaaaatctttcctaagaagcttgatcttgaacaacagttttctactttatacacaaaaacttgttccatatg atttcatttagggcatcaggcaaagcaggaactggtgatatcttactaagctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn ctgaatagttttggccaggaagcaacaattgtgccatgagagagctcctttaacagctaattaaatcttgatgtaacaga cttgaataatgaaagtataataataataagacaggttcttcattttggtaaagtcctaagagatggagttgataacaata aaaagcaaatttttataaaggaccatgtaaagccaatggagaggctggtcacaaagcaaagacgtgttgctaataacatc acatttggttagagaataaatgtaatgtaccatctataagttatttttttacttgacggtggagatgactagaggaataa tgtaaatccatgaaaataattatgttggtggttacaacaaagagcttgggcttctaacccttctgagcagtcactcttct aaatcttctaaatgataatagtttcaaggattataaaaagagattggatagttttgctgttgttgaactgtttttttacg ttgtcaaaacttaggattggccaatcctttaactcagcacctcaatttggttagaacttactgtacttggtgcttcttga ttctttaaaatgtacagtattgatggttgtgatccatatttcctttgtcgcttaaccataaatgtgacttttgttgcagc cgagttttctacatacttgaacaattgtcgatcacttcgctttgatgacaagccagattactctcacttacggcagcttt ttcggaatctgtttcactgtcaaggatacgtgtatgactacatcttcgactggaatcttctcaagtttgtgagttttcac accttgtttgtctgaatctttatggttccctttgctattcatattgtaattcttgccctttgtattaattaactttgacc aaaatgtgttaacttgtgtggttaatcacattttcctttttagggcagcggtcgagaccaggaacctggtgctgataggg gtgcacttaggggagtagagaaagctttagaaagggaacgtgaaccaagggaaccagagaggaatcatcgaagctcgacc acccgtgcagtggctggtgcaacgtccggtcgactccgtgaaccaatgagtgcagccactgcttccccagttggtgggta caaaactatacatggaaatttgttagcaaccgttacgaaacgtgttgttttactgtttttgtgtaacataacaattcaaa gcagtggcatagattacgattacgagagcatagatttggcccttggttggtatagattgtcacttgtttggtttgaatgc cattttgatcgcatggatttccatctgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnccaaaagaaaagacagtcaaacttgtttccatatgcttccacttagttgtaactttaaggttagaatcg aatttcgtttgaatcacatgaaactagactacaaatattcataatggttgctattatctgtcaatatttacagaatcgtt agcgatcctttgctacgacttatcctagagttccatctataaatttcgctggcatgtcttacacttcaaatagtctccga agtctgtccagataatagcctaatacttttctggagatcaacttctttttacaattctggtgttgtttcagcaaagtaaa ttttaaataacttccttgaattaggttttgtatagataatcgcatgagagtgagtaaaattaaggattaatatcacgcgt gttttcagaagttgctgaaattgcctgagtcacgcagcgtgatattaatccttaattttacgaggatccattgtgattac ttttaaataacatagaaggcaaaattactgaatttctgaatgcttaaaactaccacaatcgttggtcgaggacattgttc tcgta |
|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.18753.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.18753.t1 MGLGKKGSLVYIIDFGLAKKYRDPRTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQG LKAATKKQKYERISEKKMSTPIEVLCKGFPSEFSTYLNNCRSLRFDDKPDYSHLRQLFRNLFHCQGYVYDYIFDWNLLKF GSGRDQEPGADRGALRGVEKALEREREPREPERNHRSSTTRAVAGATSGRLREPMSAATASPVGGYKTIHGNLLATVTKR VVLLFLCNITIQSSGIDYDYESIDLALESLAILCYDLS* |
|