Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.18111
Locus scaf9608 : 36547 ... 42065 : -
To GenomeBrowser scaf9608:36547..42065
Genes list of scaffold scaf9608

Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.18111.t1 gi|156405565|ref|XP_001640802.1| predicted protein [Nematostella vectensis] 0.0
aug_v2a.18111.t1 gi|291239567|ref|XP_002739701.1| PREDICTED: protein FAM166B-like [Saccoglossus kowalevskii] 3.0e-16
aug_v2a.18111.t1 gi|676463186|ref|XP_009056515.1| hypothetical protein LOTGIDRAFT_150295 [Lottia gigantea] 1.0e-15
aug_v2a.18111.t1 gi|390335002|ref|XP_786484.3| PREDICTED: protein FAM166B [Strongylocentrotus purpuratus] 3.0e-13
aug_v2a.18111.t1 gi|558152757|ref|XP_006121063.1| PREDICTED: uncharacterized protein C10orf82 homolog [Pelodiscus sinensis] 5.0e-13

Transcript
Transcript IDaug_v2a.18111.t1
Definition-
>aug_v2a.18111.t1
agtaatgaaagttttccttgcttagcttttcagtagaaacgattgcaaaggacaaacgatagtacaaaatgggtttcaca
gagttgacaatcccacacagggccagcaacctgcctgggtaagtgctattattgaattatgactggttttatccagctga
gagtatcctagaatggggctggctctttctctgacaatgtacaccggagatgagtggcttgtcgaaattggtgacacagt
tttgaagggtggcttgaaaaaattcacaaattcgcaaacagcacttgaacgactgaattgaaatattgaacatgagaaaa
gctgtcatatccgtggaaaggaggacgcaaaaggcgtagcaattgtgtaactggttaaatgtaattataggctccaagaa
cgatgcattcttgagtttgtctccatttgatcggatgccaattttaaattcttcagagaagtccaaacagtttaacgaaa
agtaagcaaggcacggcagaaacttaattcccttatggaatcactcaatctaaattcagcgttattcgttctaagcattg
gaggtgaacttgttcacttgttgaaacactgacatcttctcacattgcagtacggctcattatcattcctcagttggtgg
ttgagttctttatacttgatcatcagtttatcttcaattcggttcaacacacggcaaaaatgatctcatagaactaagta
gtatctggcaccgctcgccataatttccgtacaatccaccgtacatgattcaaattttcgtattgttataacgttattta
tttctagataccgcggatactgtcctcaactgaaatatgactatggtcatacttatggaattgcaacagacaagctcact
tcagtaagtagatatgagaaaaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnccgactatttagcaggttgtatacttaactaaaatttggttcgctgaattgaccaataatagcgcgcc
tactaactaagtctaccaattctaatccttgaagaacgcgactgcaacctgacagccttcatcaagcctacacctgactg
tttatcttgacatcattgaccttacacggagcccgttttccgggcattttggcttgtgaccaacattaaatgcgctgcat
ttgcttcacaggcgaacaccgtgaattctgcgagccgccgcttataggctacaccggttacgtaccacgaaggcgagccc
atgacctgggtactaggtatgccacctgggcgaaagatggctttaccgaatcccttgacatgcgcacgaaacaggaaaat
ctttccacccaagccattgacgtcacaaggtaactaaatagaagataacatttgaggatgtcttttgaatcattccacac
tgtaactcgatttgttgtggccaaaaaggcaaaagcaaaaattaaacaacgaaacaataatttatatgaatattatgtga
actgcggacatacaaatgaaatgaaggtgtgatcatcgcagttgtgattgcgatttgagaaatcgcaattaagcccgaaa
aatgttttcggggcttcaacgggattcgaacccatggcaataattgttgttttacatataggagccccccttcaagaatt
aacgcgcagataacagagcacggcacactttacaaaaagaggggaatgaaaccaaaatacactggatatatcccacgtaa
gtaagcaaccatcaatactctttatttctgtttctcgacaaaaaaaagtagtgataggaagcacagatcatctaagatgg
tttgcattcgtgacagagaaaagtacttcttcgaaagcacattttcaagagaacgggatattgacaccgggtccagacat
aaaactagcgatcacatgggaagcgaataccaaaaatacttaacaaaaatttggttttatcaaacgagttgatgaaggtt
gaattaccaccgtgaaagatttagaaagctgacgtttcgagcgttagcttttcgttgtttgatctgacgaagggctaacg
ctcgaaatgccagctttccaaatctttcacctttcttaagaaactagaaatttatatatcgatctaaatgagtgcatttc
cggacaatccactacacttcatatctaaactggcaaaataaaacgaaaataatccgtcagagcgaatgacgaaggtctaa
cgctcgaaacgtcagctttctaaatctttcacggtggtaattcaacctttatcaactcgtttgataaaaccaaatttttg
ttctgatctctcccaccgacgcagcaccacagtttctttagaaactagaaatcaaaaatactttgatgagaaggttaata
actggcaacgatggattgatgtgggccttctatacaagtagcaacaaatgaactgaacagattaagagttccaactggat
gaccagttggctatcaacaagtgaaccagggaccagtgagaaattggaacaaatccaggtggttgtcatatcggggcttg
gagtcgggatattgctagattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaatttaaatcattttctcaacagagagtc
gattcaggtttggaaacacatatggcgacacgacacgttcattaccaatatgctttgatgtatcaggatactccaatgga
aactatacaacaacacctgttatataataagctttccatagaggaatgccatcaccttcgattatttaactgtgttaaga
aatttagtttgcatttgtactaattttgttactgtgtaccaaattagagacataaatgtcaaagtagcagatgtgaggat
tacctctgaggtaagtatgtgttaatttgactgaatgtgcatttagatgacatgcacatgtaatcctcattatcacagcc
gtccaacttgccttgctttattacttggcaatagtttactgtgtatcatttactgtgtagatctgccaagacctagcacc
gttactttgttcaactggtccttgcaacgaaacgtgttccctgtttattattgtaacagtatagtgtgctttccattga

Protein
Protein IDaug_v2a.18111.t1
Definition-
>aug_v2a.18111.t1
MGFTELTIPHRASNLPGYRGYCPQLKYDYGHTYGIATDKLTSVSEHREFCEPPLIGYTGYVPRRRAHDLGTRYATWAKDG
FTESLDMRTKQENLSTQAIDVTRSPPSRINAQITEHGTLYKKRGMKPKYTGYIPQSRFRFGNTYGDTTRSLPICFDVSGY
SNGNYTTTPVI*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495