Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.17804 |
|---|---|
| Locus | scaf9232 : 137220 ... 143503 : - |
| To GenomeBrowser | scaf9232:137220..143503 |
| Genes list of scaffold | scaf9232 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| heterogeneous nuclear ribonucleoprotein l-like | GO:0000166 GO:0003676 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.17804.t1 | gi|573878602|ref|XP_006627528.1| | PREDICTED: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L-like [Lepisosteus oculatus] | 2.0e-11 |
| aug_v2a.17804.t1 | gi|242021201|ref|XP_002431034.1| | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L, putative [Pediculus humanus corporis] | 2.0e-11 |
| aug_v2a.17804.t1 | gi|41055393|ref|NP_957393.1| | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L [Danio rerio] | 3.0e-11 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.17804.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.17804.t1 tttgccagagggacaaagtctaaagaacagtatcctttgaagtgacagatattatttatgcacagcgacagggaacttac ccgataacgatggccgcaaatatccatatttgagtaacaaaaatacaaattctcgcacgctccacacgtgcgttcgctgt ccttttctaaattatgataacaacaggaaacgatcagattcaaagtcctatggaggacgtgagcacattcctatcactat tcgtatccgttatatttggggacatccaatgaacaatttggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagcc gtaaaaaaagatagcacgcttatttgtagaaagaagtagtttgtatgtttcttaaccagttgacaggataccagccaccg acaaggatgcttcactttttcaacgctccgccaaactgtaccgtggaggcactcagagaggtgagcgagcttgattggca aatgactttaaacgttgtggatttttaattaatgtacgtgcccaccattgtgaattcctttgaagccaatgcattgtatt tgcctgctttttcttctatcgcaggttttcattacagctgggtctttgtctcctctcaaaggaacgttcttttctaaagg taggttagccaagttagttaccttttttgaagaacgcataccttaagtaagcctgattcacactagagtcgaatcgaatg gagcatgaaaacccaattggaaccgaaaatcgtaattgcagtcgtaaggactgttataagcagcgtcgcagtcgtaagga aatgggaagattttcaaaagtggcaaaatttttaaaatgcccatttttggaagttttgcaaagggtttaaggcaaaatgg aaaatatggccgatttgaaacatggcaaatacaaggcggatgatggcgtaagtgcatgtattttatcgattcaaaaacca tcttagatttgttcccggcaaagaaaaaaaacggctggagaaaaggcctcatcttcgagaagtgagaagattttcaaaag tggcaaaataatttcgcacgccgtcatcgtttctttgttaattaatgctgacatgatacagagagagatatatatatcta aggaaggaagagagcttgaaattgcaaatggaagtcattgctttggaaaatgccatctactttttgtcagtattcacgag cacgaatcgtatggaacaaatcagcacttaaataatgccgcagaatcttgaagtgagcgtttctgcaagagcgcatgcag aattgtcaaatctccaccgtgccaagaaacatttgaaggtaccaaatggtggaaataagacaatgtctcgtcataaattt aagattgcgactacaattgcatcgcttacgtggcaagtgtgaactaggctttacttgtgagatgtaagctgggagaacgg atggctaagtgtagctacgcatgatttattccagccaatgccaagtcctcagctggattgcttgagatgcctgatatccg ttcagcaatggaggctctcacgctcaccaatcacttcaccatcaacccaccaggtaccaaacccataaaaaaacgctgat ttttttttcgtaaacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttttccaagatatcatacgatatcgata tcgaccaatcagaatgcgcgtataacctggcttattgtggaatgaggttaggattggggttactgtttctccttaaagag aataattaaggggactgtcaatgtttttctcgccacaagtgatgaaattaacgaggagggtggatgaacgcttgttaaga tctgtaaacatctcattgagtgcaatcctggacacagctgaaaactaaacacacctctttcaggcggtggctcctacact ctgaaacttgcattctccccaagctcttccatctccccgacagcgccaacggttgcacccgcggttgcagctgcagcggt tgctgtgagtaatggagtcaatccgctggggcccattggctctccagtgcacctaagatgcctgacgggaagccctatca gcatcgtgacaaatggagtaaaagaattgaatggtgacgtggaaaggaatggattgtcgcctgaaaacctcgccagttca agcccctaggaagactgggcagagaagggaaccacgcaaaattatcaattgtagtcatcttgtaggtgaaagcttccaga ggtaaatgcgcagtaagtttgatttaccaggtaacaaatattcttcactcgtcaaaatagccaacgtgagtgtatgtctc aatgtgccctcattgtttatttagtttttcgtgggtaattttatcaccggtagtagaaaaaaaaaactagaaaatatttc gggtgatcttgcttaatatcttaaaacgatggaccttctgagtgatgtcgttagtaacgaatccctgcctatttcagagg tatctttgtaatggttggtatcatcggaaatatttgatgatcgtcggaaacgtccggttgtcgtaagaccttgcgaactc gggtctctcaagaaagtccatcgaattcttttatgaattcttttttagatcaaatgaagccacttgttttatttgtcgtc agcttgggttaatttgcataattatgacttgttccaatgagcatcgttggaaaggttgaactggctatgatcttataaca ttgccattaatattaaaccataagcaattcttttccaattattaacaagtatatgacatttgccagaaactgaatgggca attttcttcaaactcgaaattggaatgagtataaagagttttttctttaaggtaaaatgaggtgttttctccgaacataa tagatatatataataatttcgaaatacatggacatggagaaaagttagacttttccatgaaattgctatccttaaaatgg cgttatcttactccacacatttttgtcccttattttacattaaaacaaaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nggaaaaaatgttcttgttttcataaatattgcatatcaccctctgtttggtatttataactccagatgcttttcatttt ttcacacgtgtcacatatcgcatttattcagcattttgatcctcgatttcagttctttcactccccagctgaagatttcg tggttggtgtgaagtccaagtttctttttgcgaagacttataccccaaaatttcctttagtagttttgagttagatgggt aaacttttgggtttacgtttcgggtttttactatcctttccccaattttttgtaagaaataatttatgtttaagagaagt gaaaatttgcaaagatctcgttaatgatcattgtgttattctcgcaaagtcaaaagcagttagtttgaaatcgtctcatt tcttgggcaccatatgggccctataatgcaaaaggcaaccgtttttcccctctccaaaaagcaaagaaaagattaaatat cccccaacaaatataattatcttattaagaataacatacattttttgtggttaaaaatattgtgaaaatttaaatttttt tcagagataatttcagagttattgcctaatattgaatgtaatgcactcatgtgcatcatacaaaacaaatacaaatatgg aattgtgaaatcgtacctcgagttttcgttcttgtagaacttgttcttcaagttcaaaacgggaatttattgaagtggag ttgactgaacttgcagaggtttttaatataattgcacatatgaa |
|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.17804.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.17804.t1 MLHFFNAPPNCTVEALREVFITAGSLSPLKGTFFSKANAKSSAGLLEMPDIRSAMEALTLTNHFTINPPGGGSYTLKLAF SPSSSISPTAPTVAPAVAAAAVAVSNGVNPLGPIGSPVHLRCLTGSPISIVTNGVKELNGDVERNGLSPENLASSSP* |
|