Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.16488 |
|---|---|
| Locus | scaf7750 : 1668 ... 7885 : - |
| To GenomeBrowser | scaf7750:1668..7885 |
| Genes list of scaffold | scaf7750 |
Manual annotation
| Study field | Photoreceptors / Circadian |
|---|---|
| Gene name | Adi-Cry4 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| cryptochrome 3 | GO:0050896 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.16488.t1 | gi|742142383|ref|XP_010879200.1| | PREDICTED: cryptochrome-1-like [Esox lucius] | 0.0 |
| aug_v2a.16488.t1 | gi|657596853|ref|XP_008303150.1| | PREDICTED: cryptochrome-2-like [Stegastes partitus] | 0.0 |
| aug_v2a.16488.t1 | gi|658856297|ref|XP_008410797.1| | PREDICTED: cryptochrome-2-like [Poecilia reticulata] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.16488.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.16488.t1 tcggtgtcgtccgttgatttcccttgtttacaacttaagttttttacttacttgttgtaaaaagagggtttttcggcggc tattttctttaaaaccgtgagatctactggtaagtaaatatagtggaattattagtgaaagtaacagagtgttttaagga attattttaatgaaaacaacagcgcacgtctattattaattatttggggcgccacaagacgccaacagcggcaagatttt tagaaaatacttttatcaaagatctgtttgtaaagggaatcaacttcggtcattgattgaagatttagaatgttggaaga aacttctgtccttattaaataaccaagatcacgtagttaatgcttttgacgtgctcctgtcttgtgggtttgctcatagc tactaattttggtttgcttagaatccatacaaggagttggggttatgaaatgtaaccctggtcacagtacaaagtgtaaa tttacttgaaattccaaaaattttacattataaaacatttgatggcaaccatattgacctctgatctcaaaatttgtttg gtgtttatcgatgaatgctcgaatgcacgttcttgcgttttgcataaaagcgttcgtattttatgggtacaattgaatag tcttgcttggaaacattcacaaatttactacttaaattgaaacaagtaacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn gttagctgaaattcttgtaatgaaattcaacaagcaaggagtgcttgagagttatataagaattaaatatcatggactta aggctgttgagatccttatataatgaggcaaattgtttttagtcacaagcactgcatgcttcctagtcagttagtcaggt aatttgctgatgacaagtctcatgcaaatgtggacctatgtttgttcagtaattctgttgtcatctcgcttacagtggta aaaacagcacagtcttgcctggtaacttgtaagaattgttttgtttgtggatcacaaatactaagactcgctgttaatta aggagggtaattcatagttaatcagaaaggaaattgatgcatgaaattgttgtgttagggactttggccgctctaggaaa agaactgtttgttcaatatcttgccaatggtcgttgtgagcaatgataatcattttgatctaataagaatactagtggca ttctggacataataaccaatgtcgttctacacatcttgcacagaaataataattcatgtccatttagtcaggcagaaacg agacagaaatccccctagtcacagctgagttaagaccaaagtacatctttgatttgaatggcaaaggtggtcttaatcat ctgtttctgttgtccaaggttgaatgtagtttgttgtttgtcttagtatcattccaagatcttcaaagtttcccaaagac cacatagaaattcacattgaaatgtgaaattactgtacatgtggatttggagtagtgggctaagattaatgtcaacttct tgtagacccaccgagtgcttctccaccaaccggcctgtattatcggtgatgaatttattaattttaacaactattatctt tcaattgcaaagtacttttaaaaatactgagtttcgcaaaatgttttttgttcacagaattataatggaggataagaaac caagaacatcccttcactggtttcgtaaaaatctgcgtcttcatgacaacccagccttgtgtgaggccattaaggaaagt gatgattttttggctctttatattcttccaccctctgtccccgatggaaacatagcagcgaaccgatggaattttctgat tgaatgcctggaggatttgaaccgtagtctggcaagcgttggttctcgtctgcttgttgtccaaggatacccagcccagg tgattccaaagttgctaaaacgtctgcatgtcaccaagttgacatttgaaagtgaaagtgagccattcagtaaacaacgg gatgctgtgatcacccatcttgctgagagcatgggagttgaggtggtttcttgtacttcacacactttgtatgatgtggg caaagtcctggaggcaaacaacaatgtaacaccaatgctatttgacagcttccttgatgttgtagctaccttgggtccac cagaacctcctacacaaacagttagccaggatatgatgtcttcgcttttgcacaaagcaaacatgtttggggactgtgac ataccagctgtagaggatcttggcattgacagggccaaggttacatgtcaagaaatttggtgtgggggtgaatctgaggc cttacaaaaactccatgccttccttaaagaggtacaccacatattaagtgaagttttacagaggttttagtgttttttct ttctgccggcaaaaacgtcttgcttgcatgatagatgcatgccaaccatgaaccaagggtgcaatgtatttgacacaaca gataaggataacagatctctctgtcaatatgtcgcctgggatgttttttgaattatttataaacgatttgtgaagaagtt gaatttatagacttatgtcttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttctggaacctag ataatctaaaactactgtaataaccaatcttataaaagaacctatttagtctaacttagaaaatctaggttcttatatgt gggtgtttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcatcaacgcccccccctccctttgattttaactttattgcaggcaa aaaagcagtatcccccgcagtcactgttcttctcattgttgtggagggatttctattttgtacttggtagcagtaatcca actctaaaccaaatggaaaataatccattgtgcttgcaaatcaactgggaccagaatgtcgttgctttggaaaaatggaa aatggtaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnngcctgatgatacttctgtcgtgccataaggtccataattgaatactcataccagttgtttcacagttgtg tcccctgttacctgtctgatgagatcgagcgcattcagcgatgtgccatgtgcatcatttttccagatgtgaagtgtagt agtgctctgagagaagcagggattcaaacggtttatgataggagagagaaactgttatgtgatcttttcaaaggcatgat gtataataaggaacaataagctggcaagtctgctaccacccaagaatatcaataattattgcagacatttaaaatcagta agaactttaaacactcctgtgtgtaaaacagattggtttaagaaatctttcatgattagccatagtcttaaaatgtagac cataaaattattcttcagatatttcattttaaatctaagttatatatttaattcttaatagttttttgtatttaatagaa ttgtagttattatatttattgtgatgtattatagtgttttatatattatcgtgtaattcagtcttgggagtgagaggata ttttatctaatgaatattttatcgatcttgtcataatcatcattagaggaaaacaagtcatcattatataacagtatcgg tggtaaatgtgaatctgaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtattaatatagcaagaacacaaaatgttagcttatt ggagaaggcatggtcagggcttaatgtccctgtagcttgaaatctatctttctagttcaaaaatggtcgtttttacttct acaggttgcattgtttgctgattgtggatatgaacaagaagttaacattttgatttctcttaatagatctttggggagtt gcagctggatgccgagtggagcctcagtgcaggcagttggttgtcgatttctggaagttcttttgatcaaaaccgactgg ctcttttttgtcctgtagagactgccaagaagttggatccaatgggagagtacatcag |
|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.16488.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.16488.t1 MEDKKPRTSLHWFRKNLRLHDNPALCEAIKESDDFLALYILPPSVPDGNIAANRWNFLIECLEDLNRSLASVGSRLLVVQ GYPAQVIPKLLKRLHVTKLTFESESEPFSKQRDAVITHLAESMGVEVVSCTSHTLYDVGKVLEANNNVTPMLFDSFLDVV ATLGPPEPPTQTVSQDMMSSLLHKANMFGDCDIPAVEDLGIDRAKVTCQEIWCGGESEALQKLHAFLKEAKKQYPPQSLF FSLLWRDFYFVLGSSNPTLNQMENNPLCLQINWDQNVVALEKWKMIFGELQLDAEWSLSAGSWLSISGSSFDQNRLALFC PVETAKKLDPMGEYI |
|