Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.15424
Locus scaf6564 : 1048 ... 4375 : -
To GenomeBrowser scaf6564:1048..4375
Genes list of scaffold scaf6564

Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.15424.t1 gi|449690046|ref|XP_004212222.1| PREDICTED: heat shock protein Hsp-16.1/Hsp-16.11-like [Hydra vulgaris] 1.0e-27
aug_v2a.15424.t1 gi|449677322|ref|XP_002158752.2| PREDICTED: alpha-crystallin B chain-like [Hydra vulgaris] 2.0e-27
aug_v2a.15424.t1 gi|221106831|ref|XP_002160804.1| PREDICTED: heat shock protein Hsp-16.2-like [Hydra vulgaris] 1.0e-26

Transcript
Transcript IDaug_v2a.15424.t1
Definition-
>aug_v2a.15424.t1
aattattcacgtctgtttcacgtgggagtcaccctcggggcttaggtcatgtgtccagaatggaaagtaatcgaccagta
aaatccctatggtaagtcaaggaaaacatctcgttggtcatcctaaactaatagatatcaacacaattttgtgtaaaagt
gctctgatagtcttgatcaatggaaaatcaaagatagagaaataaacagaatgaagacagctgataggtcaaacctgtaa
caaagtgcatgacacatttccaggtgacctggtgacgtaatttggaggactggggagaaaagttttaacgccgtatccca
caaccgcgtgcggccttattttcaaattcaacatggcagaggctaggttagagctcgtcgggtctacttgaatgttcatt
cagtaacaggaaatgtggtagacacggaatgatctgttgagttttggcaatggaaatactgcagggagtttggaaacaac
acctaaggccgcgggcggttgtgggatatggcgttaaaatttttctccccagtcctccaaattacatcaccagatcacct
ggtttagtgggtagaaacacaaaagaagtagttggacaagaggagaacaaaaaataccacatcagacacaaattatctta
taatccctgcattatattgtatatttacgatttactatttctgtgttaatatatgtcacaaacttactccagttttatca
ccagtaacaaaaattaattgtttgctttcaatggtcaacttatataaaattcaataataacattatacttgatttggctg
atttatagctccccaaacaacacaaataattatataatatctcctgcagtgaccagccaactcatagtgataattaaaca
ctctgcagcaacttgcatggcacttctggttagtctgttaaatttgccactcatgacaatcaaaaaaacaatttctcata
ggaaacaattatatagcatagaaacttatcaacactgttgcaaaaacaaagtctttttcaaaaatctgattctgagagat
ttgcaagaaacgcaaattaactgccaatgaattatttaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtccgtcatatcacagtccgccc
gaggtccaatcaagattgccacaattacactcaaccagtacaaacctgaagatatttcattggatgttgacgctgagaag
atcaccttgcatggccagcatcgatcagaggatgaaaacggatttgaaaatagccagttcaagagagtcatcaagatccc
agatggtgtcgatccgacatcagtggcatcgacagcgagtgaagatggaagagctttggtactcacgggaatcaaacgag
tggaagaaaacaataaagacaacgacaaaaaatttgcagtcaagttgaaccttagtggatatacacctgataaaatcaaa
gtccaacttcgtggtcaagagctgacagtcattggaaaacaacgctcagaggaggacggtttgcaacggtcacgtgatta
ccatcgccgtatcctccttcctgatgacgcagatctcagctcagtgacctcacgactgtcgttgttgacgatcgaggcac
cacatgatgcagctcttttgcctagttaaagaagtttggatgtcactatggaagaggtcgagtctcaaattaaagatgag
gcaaattcgtcgagtaatacagaagaagaataaaatttagtagctaag

Protein
Protein IDaug_v2a.15424.t1
Definition-
>aug_v2a.15424.t1
MSARGPIKIATITLNQYKPEDISLDVDAEKITLHGQHRSEDENGFENSQFKRVIKIPDGVDPTSVASTASEDGRALVLTG
IKRVEENNKDNDKKFAVKLNLSGYTPDKIKVQLRGQELTVIGKQRSEEDGLQRSRDYHRRILLPDDADLSSVTSRLSLLT
IEAPHDAALLPS*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495