Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.14163 |
|---|---|
| Locus | scaf5884 : 6417 ... 18845 : - |
| To GenomeBrowser | scaf5884:6417..18845 |
| Genes list of scaffold | scaf5884 |
Manual annotation
| Study field | Cell Cycle |
|---|---|
| Gene name | Adi-cdk20-2 |
| Description | Named thus because this protein shows similarity with Homo sapiens cyclin dependent kinase 20 by the BLASTP search. |
| mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| cyclin-dependent kinase 20-like | GO:0004693 GO:0005524 GO:0005634 GO:0005737 GO:0005929 GO:0006468 GO:0007049 GO:0007275 GO:0051301 GO:0060271 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.14163.t1 | gi|597763938|ref|XP_007245900.1| | PREDICTED: cyclin-dependent kinase 20-like isoform X1 [Astyanax mexicanus] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.14163.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.14163.t1 gtaattcgctccagttcactcgtccaacatggcggcgttttcaagactgtttacgcgactgttgcgatagcacttcctgc catttttgcatcgccaagaatttaaaagtcgtgaaaaacttaagttttacccaaccatgaaaggcttttcatgcgaaggg atttttacctgaggctcgatctcgattaaatacgttttctgctgttgccatggagcactacggtcagtatacaattcttg gaaacatcggggaaggagctcacggaatcgttttcaaagcgaagcacatcgaggttagcttcattttatcgaagaggatt tttttttatcctaaaattcagaaatttttaatgggatttattcttatgataccaggaggagagctgtgtcacggttgtta gagatgaataattgtttttatattttgtcgtttatttataaatctgtttttaaatttgggtatagttttgttctagagct aaataaattatacattgtagttaatttagttgtaaatttagttgtattggttagatgactgagcgacttgtcagtattaa aaaaagttaattgatgtacagttgaaatatgtggttgaaggaagtttatccacagaatacatttggttcttagtgactgt ttttagatcttaaaaaggaagtttgaagagactaatgtccatggctcaattgacctctttagcttgaatgttttatccag acaatgtgatagtctgaagggactacatagttatgctttcattttgtgcgtgtatagaagattaaatttaatttcaaagg aactgttccaaggggtatcatctcatgttcatcactggaaaaaaaatcttaaggctgaagagtttgtagttgctttttaa tagcatgacttaggtcgagcatgaatgcattctataaaggttgtgttcctttaagccaatctaaatctagattttacgat 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Protein
| Protein ID | aug_v2a.14163.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.14163.t1 MEHYGQYTILGNIGEGAHGIVFKAKHIESGEIVALKKVPLRKLEDGIPNTALREIKALQEIEDNQNVVKLIDVFPYGTGF VLVFEYMLSDLSEVLRNSDKPLTEAQIKSYMLMLLKGVAFCHENSIMHRDLKPANLLISSTGHLKIADFGLARVFRNEAN RQYSHQVATRWYRAPELLYGARQYDEGVDLWAVGCIFGELLNNSPLFPGESDITQLYCVLRVLGTPTQGQGMTELPDYNK IVFPEMPPIPLETIVPDVSPEAIDLVKRFLVYPSKERISASEALLHPYFFTRPLPAHHSELPIPARNARRTSGRGQLRRA FDIDVPMEKSLVNPALLVHNVAGMPNFQP* |
|