Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.13302 |
|---|---|
| Locus | scaf5392 : 47536 ... 62989 : + |
| To GenomeBrowser | scaf5392:47536..62989 |
| Genes list of scaffold | scaf5392 |
Manual annotation
| Study field | Photoreceptors / Circadian |
|---|---|
| Gene name | Adi-grin1 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| n-methyl-d-aspartate receptor subunit nr1-3a | GO:0004970 GO:0005234 GO:0016021 GO:0030054 GO:0034220 GO:0035235 GO:0045211 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.13302.t1 | gi|156368325|ref|XP_001627645.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
| aug_v2a.13302.t1 | gi|676490394|ref|XP_009065255.1| | hypothetical protein LOTGIDRAFT_108357 [Lottia gigantea] | 0.0 |
| aug_v2a.13302.t1 | gi|225350158|gb|ACN87989.1| | N-methyl-D-aspartate receptor subunit NR1-3a [Xenopus laevis] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.13302.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.13302.t1 gaaatgaaagtaattctgaaggcgcgtgggagaggaaatacgaatcgaaaatcgcaaacgggactcagctctgttttcag aataggttgcatttcagctgtcagaactgtactagacatgtgagcgaaatgctttaaattgattaccaacagccatggat cgctggattgtttcaatgattgtgacatatttgtgtgtcgtagtcgtttttcaagcacgttgtaaaacgaccgtttcttt cagaattggggcgatgctttcgtcttcagaacacgagaatatcttcaatgacgcagtgaagaaaatcaaggctgattcaa gtaatgttttcaagacggcaaagttcgatgcgagctcgtttgttttgagcacaaaccctatccgctcagcaatggatgtc tgcgaaaaagtgattgctaaaggagtagtggctgtgatcgtaagccatccaaaagatgatacgtcgccgccaatctccat atcatatgcctgcagtttttatcatattccggttattgggatttcggcacgagagacaattttctcggataaggtattag attgtatgatgtattatgtaatattaacaaattttgactcggacaaattccctttgtaaagaaaaggcggttttctactc cgcaaaatgagaagatcgataaaattcgcttaaatttattcatacaattatgatgcttgaattttaagagatacccgtgt aaagttaaagcatcgatggctatgccattgttttaatttaaattatggccctcgttcagctaatagcttgatctttcttt actacaatttttaataacgctggtagtctcattgtttcttcttttaatttataagaaatgccagaaagcttattatattt gataggcctttttttgccttaaagaaaattcagcagtttaatttaggaaaggtagggtgcctttgtgttttgttttgaaa 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|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.13302.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.13302.t1 MDRWIVSMIVTYLCVVVVFQARCKTTVSFRIGAMLSSSEHENIFNDAVKKIKADSSNVFKTAKFDASSFVLSTNPIRSAM DVCEKVIAKGVVAVIVSHPKDDTSPPISISYACSFYHIPVIGISARETIFSDKSLHDTFLRTVPSYSDQAYVWLGLLRHF RWNKVILLTSNDQDSRMIATKFTGLAERNKIKIEKTILFQTGCVNATSQLVKLIKMQSQVILFSASEEDATVVYQNAFQL GITRRGYVWLVTEQSFTGTARHELPQGAVGMRLSYGNNESAQVQDAVSLVAKAINRLLAANRSLTPPTSSCKETSQWDSG QILFHELVNTTLENGRTGKLLLNGNGDRINSVYQILNLKSRDDKELTVVGEYRDGQVSINEAISWPGGRTERPEGFLIST HLNVVTLVGEPFVFITTMPSSGRCEDLDTANGKERHIKCSGKVYGEHAKLVTSDKNDHCCYGFCMDLLKRLAKKVNFSFD VHLSADGSYGSLRRVNGTVMKRWNGMVGEVIDDKSDLIVAALTINNERAEWIEFSKPFKYQGLTILVKKDQSSNRLDSFL RPFQINLWLLVLLSVHIVAVILYLLDRFSPFGRFKLARKEKEETALNLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGTPRSFSARVLGMV WAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPKAVVSGIDDPNLRNPSGDFKYATVANSSVDAYFRRQVELSSMYTFMEKYNVKTAR EAIQKVKNNELKAFIWDSPVLYYEASQDCMLTIAGELFGRSGYGIGMPKGSPWTNNISLAILNFHESGVMEELETTWIDS KNCAEQSNSPATLGLSHMLGVFIMVAAGIGAGVVIIILEILYHKHRGWKEEQKEIAKKTTDKWRANILMMKKERTTNGRQ PNGVLDSHAPQTDGIARRNPIYNPENHVDGTFTYT* |
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