Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.11531 |
|---|---|
| Locus | scaf4501 : 32958 ... 41125 : - |
| To GenomeBrowser | scaf4501:32958..41125 |
| Genes list of scaffold | scaf4501 |
Manual annotation
| Study field | Autophagy |
|---|---|
| Gene name | ATG4-1 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| cysteine protease atg4b | GO:0000045 GO:0000422 GO:0004197 GO:0005829 GO:0006501 GO:0006612 GO:0006995 GO:0016485 GO:0044804 GO:0051697 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.11531.t1 | gi|260795879|ref|XP_002592932.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_275700 [Branchiostoma floridae] | 0.0 |
| aug_v2a.11531.t1 | gi|449666316|ref|XP_002168183.2| | 0.0 | |
| aug_v2a.11531.t1 | gi|47087191|ref|NP_998738.1| | cysteine protease ATG4B [Gallus gallus] | 0.0 |
| aug_v2a.11531.t1 | gi|701415321|ref|XP_009972179.1| | PREDICTED: cysteine protease ATG4B [Tyto alba] | 0.0 |
| aug_v2a.11531.t1 | gi|698396707|ref|XP_009694027.1| | PREDICTED: cysteine protease ATG4B [Cariama cristata] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.11531.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.11531.t1 gcggagtactggggcagaaatgacgatgtttgtaaactgaacatcgaaaaaaagtatggctggctcttctgatatggacg cgacctgtgcgacttacgaagcgatttcttttgaacatgatattttcccgcgaactaaagaaccagtgtggattcttgga aaggaatacattactaacagaggtaaaaggttcggtttttttggcagtctcacaaaatattggcgtatttctgaccgtaa aaatacaagctcttcctttcatttcttggcaagaggtttttccgtgcaactttgtatgagttcattactagtcttactgc aacaagataatatttaaacttctctttttggtgagacaacaaatactttcaaattgagtttgtacagtgtaaccaaaagt cttaatttatttcacttaacactcaatgcaatgaaaaacaaatccgctgtcatctttctaaaaataaaaaggaaaaatac tcttcatggtcacaggttttctatcctcatgaagtttttctctatttgagttgtaagtgaaagaaatatatcttcttaat aatcatttttaggggatgacaacaccaaaatcactcgtgatatcaagtcaagactttggtttacatacagaaaaaatttt cctgcaattggtgagtgatatactaggaaattaacgagattattatcatcatcacctgactgcttttgttgtcattaatt acttggtttccatgaaaggtgtaacaattcaaattttgcaatgatagcgagttgtcagctcaagttatttccaaaatact gctgtttctaatagagtagactcttggatcttttaaagtgtttacagtcagtgactaccatgagttatttattgaaaaca tttttttagagttgattttcgtcatcagcaaagttcatcatttttgctgttgattggttaatgtaccttcatctcactgg 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|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.11531.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.11531.t1 MAGSSDMDATCATYEAISFEHDIFPRTKEPVWILGKEYITNRGDDNTKITRDIKSRLWFTYRKNFPAIGGTGPTTDTGWG CMLRCGQMIFSQALMYRHLGRDWQWDSETMHPVYMQILQNFLDKKDSLYSIHQIAQMGVSEGKPVGSWFGPNTIAQVLKK LTSFDDWSSLCVHIAMDNTVIIDDIKLLCKGDWVLRTHCETTQNSCTSSERDKWRSGSKEGVKHRKNQWRPLLLFIPLRL GLSEMNSVYNEPFKACFKFRYSVGAIGGKPNHAYYFIGFYGNNLLYLDPHTTQQAVNPEKMSQIPDESYHCVHPSRMNIS DLDPSIALGFFCKTEEEFDDLCEQINEHILSCQRRPMFEVAKKRPPHWPSLELPQRLCDEFNCSHQSDFTELNYESDEEQ EFDTDGEYEIL* |
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