Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.11397 |
|---|---|
| Locus | scaf4421 : 78892 ... 88125 : - |
| To GenomeBrowser | scaf4421:78892..88125 |
| Genes list of scaffold | scaf4421 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| acetyl-coenzyme a cytoplasmic isoform x4 | GO:0000166 GO:0003824 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.11397.t1 | gi|585708458|ref|XP_002740861.2| | PREDICTED: acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic-like [Saccoglossus kowalevskii] | 0.0 |
| aug_v2a.11397.t1 | gi|470643692|ref|XP_004326316.1| | PREDICTED: acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial-like, partial [Tursiops truncatus] | 0.0 |
| aug_v2a.11397.t1 | gi|544465250|ref|XP_005568856.1| | PREDICTED: acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic isoform X8 [Macaca fascicularis] | 0.0 |
| aug_v2a.11397.t1 | gi|564246082|ref|XP_006262157.1| | PREDICTED: acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic isoform X4 [Alligator mississippiensis] | 0.0 |
| aug_v2a.11397.t1 | gi|557330722|ref|XP_006038227.1| | PREDICTED: acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic isoform X4 [Alligator sinensis] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.11397.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.11397.t1 cattacaggtgcgggttacatgtcactgcgtgacattaaaatcacatgctgttattgtgtaaacaaatagccaatcgatg tttgatttgaacagaagtcgaaaacatggcgaatccactgattgtacgaaatctatttcctgcaaggctttcggcggttt tctaccgtcggatttcttctttctttacagatgaatacaccccaccaaaactcgatcatgttacctcagactggcacgaa ctttacaaactcagtgttaaagatcctgctacgttctggggccaacttggagcgtctaggttggagtggatgaagccttt tgacaatgtaatggatgtggatctaaatttaggacagcataggtggttttcgggtggtaagcttaatgtttcaggtgagt ttttgcgatcgtttcttaacaataattgtaatattgccgtttcataccctctaaaattttacctcaattgaaggcatgag tgcatgtcccgtgagaagtttgatttttcatagcatcctgcgttgaaacttcaccttaatagatgattttttttgtcaaa atttaaagatgctcgccgtcaccgcaaaacattttgcacttaaaggattattttaacactcgtttcccttttgggtcttt gactccacccaaaatgagcaaggtgagatgtgaaagaaagtgacactccttctgttaaggggttttcagtgctagttaca tgttgataaaggttacagttgtaccaaaacatactaataggtaaattgataatttcaacaaatcttgaacagttatttga aaattattatagatcagaaattgttaacattgaatctgtaattttcaaagtcagcctgagactgtctggctcctcaaaca cttggccacactgccttgtgatatattatgtaacactcaaaggctcaaactaattaatgcagagaaataaatttgatact 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|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.11397.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.11397.t1 MANPLIVRNLFPARLSAVFYRRISSFFTDEYTPPKLDHVTSDWHELYKLSVKDPATFWGQLGASRLEWMKPFDNVMDVDL NLGQHRWFSGGKLNVSVNCVDQHAKADPDRCALIWEKDEPGDIERVSYRKLYEMVNRMANMLKSHGVKKGDVVCIYMPVS PLAVAAMLACARIGAPHRLEMTKQSTQCEPEPMDSEDILFLLYTSGSTGQPKGVVHTQAGYLLYAKLTHKYVFDYHWGDI FGCVADIGWITGHTYVVYGPLANGATTVLFESTPTYPDPGRYWEMVERLRINQFYGAPTALRLLLKSSNSFVTKYDRSSL KLLGTGYYFTGDGALRDKDGDYRITGRMDDVINVSGKRLGTAEIEDAMDSHDAVAETAVVGFPHPIKGEGIYAYAILKDN STISAEDLRKDLKDIVRQKIGSFAIPEVIQVVSGLPKTRSGKIMRRILRKVAQDKPDELGDVSTLADPTVVEEIVRQHMQ LMREVRAKHE* |
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