Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.10257 |
|---|---|
| Locus | scaf3932 : 160331 ... 166465 : - |
| To GenomeBrowser | scaf3932:160331..166465 |
| Genes list of scaffold | scaf3932 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| sgnh hydrolase | GO:0004553 GO:0008152 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.10257.t1 | gi|21226028|ref|NP_631807.1| | 5.0e-09 | |
| aug_v2a.10257.t1 | gi|504489511|ref|WP_014676613.1| | endo-1,3-beta-glucanase [Streptomyces hygroscopicus] | 1.0e-08 |
| aug_v2a.10257.t1 | gi|504488093|ref|WP_014675195.1| | glucosylceramidase [Streptomyces hygroscopicus] | 2.0e-08 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.10257.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.10257.t1 tgtggtgtccacacactccagttcctctcagtcactgtgaatttcttattgtattgctgctggggtcctgctgtctctgt ttctctaacagcaggtttgtttttcagtattttaaaatgtaaagtactaataaggatagagtttaagtttggcgtttctg tgtttcaaggccgctgcactttggaaatatctggaaacgtgtttgttaccacggttcttttcgctaacattgacaaataa ataaggggtatcaaatagtcccatccaatttgaaagtgctcccaaaatttggcctttgctcgaaattttcgcaaaaatta gaggcgtgctcgcttgttcggattttccttaaaattccctgccgtgtagcataagcataatttcgatcttgaagacaaaa actggcggcgctggaagcactgtttcccctatggaaaactggaaaacattggagaaacatgcgcgcgccatgaatgttac tggaaatatgcttcctcgttctgtcgacatttattgaaactgaccggtccgccgctgagttcagtctcaggtagcaacgg ggtaaccctacctgaaagattcgcttgtaagggcgagttgcttgtaaacagggccttagaaagcttcagatcccgtttag cgtccacccactgactctcatgaagctaagtgaagtaatattgctgcaaacggcatattaaacaaggcataagtgatggt tgaaccgcgataaggccttattatgttgcctagctttaagtgtcagccagattccttggtgcaaaacaacgtttcaataa agaaagataccagctggcggaagatttacgaagtgctcgctgctcgccctttgtaatttcaaaagtgctcgctgctcatg agaaaattgatcactgctcgtgctcgccaaaaaaaaaaacaactgctcgcatgctcacaaatgctcgcaaaaattattcg 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|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.10257.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.10257.t1 MSNILYLVVFTGFFSSAASQVNCVNKIEIGEVRVLKSRSCIDISGKSGQGNVLTYRCESSPDQQLIICDDGTIRNMKSNN CFSAGTTGSGNVISTTCVLFPKIPEYQKWKFRKSKIFKDRGGILQEAREIINMKSGKCLDVTGIEGNGNIGTYSCTDEQD QYFYFRSRGKLLAHGRLQVQKSGLCLDVSGDQGGKGLHDNNVLIYNCEKAADQSFSFYENGELVNDESGLCLDVSGMDGS GNVLMYECEGTSDQMWSQPRQYCDGDYCSFVNNASGKCLDVSGDQASSGSNVLAYDCEGAPDQRFKWVSGNWVTPTADWD MVGCNQNGKVTQRISNKIQYSKTKSDTSTNEITAAIEAKTKFVGGSISRSESSSLSKEWKRSQSQTNMITFTCENYDSGE PFVRGCMWQLQVTTKERHSENEMTWTPLIVKCTRNLEKPRCPPFTRCMDEDCTRCEEIPTSRAGLNKRFFLNLNKK* |
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