Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.09657
Locus scaf3696 : 17207 ... 25385 : -
To GenomeBrowser scaf3696:17207..25385
Genes list of scaffold scaf3696

Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.09657.t1 gi|156376516|ref|XP_001630406.1| predicted protein [Nematostella vectensis] 0.0
aug_v2a.09657.t1 gi|585722944|ref|XP_006813549.1| PREDICTED: nitrogen regulatory protein NUT1-like [Saccoglossus kowalevskii] 1.0e-33
aug_v2a.09657.t1 gi|736204110|ref|XP_010775326.1| PREDICTED: GATA-type zinc finger protein 1 [Notothenia coriiceps] 6.0e-31
aug_v2a.09657.t1 gi|554871680|ref|XP_005945791.1| PREDICTED: GATA zinc finger domain-containing protein C1393.08-like isoform X2 [Haplochromis burtoni] 1.0e-28
aug_v2a.09657.t1 gi|548535226|ref|XP_005752290.1| PREDICTED: GATA zinc finger domain-containing protein C1393.08-like isoform X2 [Pundamilia nyererei] 1.0e-28

Transcript
Transcript IDaug_v2a.09657.t1
Definition-
>aug_v2a.09657.t1
gaactttgctgtaagactgcttttactcggctaaacaagacacgttccaataaaacttcgtttgcctcgcaattgaatcg
cttctatttcaattaatctcttctaccttaaattctggtctcatttatattcatgataatgattttccggagatgataag
gaaaaagcaaatgagtccagtgtcatgaactgcgtgtattttgtggcattagaagaaatcagagagttaaaaaaaaccaa
cgtcgcgagccgttatctacggcagcgaaaatgtttcttggaaatagacattcgtgcaacgtatttatctggccgttatt
tcttattgctcgcagtctatattgttgacaaagtacgctacaaatggactggtagtaattatgaggaatgctcacgtgaa
aaccttaactttgaatttcacgctgttgttttgcagactatgtcaacgtgcagcatttttcttcgtataaccaatcagat
cattgttttctggcgttgtctttgctgttgtcgtcgccgtactcttgatagatgtggcttagtccccttggtttctcaat
aaatcattttacagttatgcgcttagtttcctggcctttgaatgaaagttaggctggaggtgaccttgagatagaattag
gctaacctctttaacctctcatgctaattagtacgaatttacatgagaaaagagtatatttccgtaaagtctataaccgt
cttgactggagaaatgctgagtcaactacttcttcagtttgtactgtgggggctaggctgaatacccttcaaattcttca
actgagtagactaccggatacagggccacctttaagactccactggtatgccctgccgggtcgtttggctcggtactgga
gccaaacgagccgcgaaacatcaagactcagaatttgatcatgatataactcgttcttgcattcccgccgagccggagcc
caactagcctctacttatttttccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaactcaggttactgtaagtgacaggtagt
aatagaagaccaacctgacaatatagaacacttgctagaatgaagcatactaatagtagttcatatgttcatggtaggca
atagcatctggtggtgggattacagagcctcttcctgaaaaaagtgagttatctccagtttcatttattttatagttggt
tcttgtttatcttaaatcagtcgtggtagctggtgaaggtgaatcatcctcgtggcttttagcactacttaagcagttca
ggcctgaattcttgcaactgcttaagtagtgctaaaacgtatgaggatcaatcaccttcttttcaatctgcagttgtgat
gcatgattttcatgtatttacatcatatatacataactaacaatgataactttttgcaataataaattattgtcttttgc
agaggaagctagttcccatgcagacccaatacaccatcagtacagtcacattgggcatactcacaagagtatgttattat
attttgtcattacatatatatatgtatgtatggaaagcaattcttgaaactaaatggattactccgattgttcacttctt
gttcagcactgaaaagaacagtccacaattaaggaaactgtgcacatgttaattttccacttgctgactcccaggaaatt
caaactgcaaaaagcaaaaggagaaaaagaagttgaggtgttaagtaattgtttaagttcttctactcccagagttactt
ggacgatctaagtcaatcaaaacggtgacaatgaatgaattgtataagagtgcaaccgtagtttgtcttctgcaccaagt
caatctgacctcttatacactaaaatgtcgatgtttgaatatagtaatggcactcactttgatattctataggctcccac
aagaaaaggaaacataaacgacacaggtacatgtcttttcatgtaacattgctgtaatttgttttgctgttgagtacatg
acgtgcttatgtaaattaatgatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattaccctgccagtgaattgcaagaaaactaatcttgtgtctcatttaattat
tgttatctattgttaaattcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcacaaacttctttcaaatcgaaaaacagtcgatgatagctatcttcctag
gaaatgagagacgaattcgtccccttaaaaaaagaaaaactttttatgtaccaaagtccctcattgcagttgcgaggcac
aaaaagaaagccttcagtttttttattatcccatcgatgaccagtgtttttaaactcgtgtggttgaggtcaacaataac
aaacatagtgaactattgagacaatctgaattgcaaacaatccgtgtggagggaagggaaggaggtgctcgtctttgaga
atggcctcaaaaagcaagaacttaaccatttcgtctctccgatattgaaaatgattcagaacgtgtctgttggtaggcaa
tgtatctagcaagggcaccgaaccaaatatctgcgaagactcacacaaaggaagtcatctgctgttctccattccacctt
tgaaaagcagacctttatttactacaaacttacctcgcccagtagtaaaggaaatcgcaaaaacgctaacgtttcggtgt
gattttcagctgaattcgatctaaatggagtaaacaagattaattgtgtgaaggatgacaatacagaaggccaatccagc
atattttcttttgaaaattaaaccaaaacagctgattttcttataaaggtgtgaaatgatcgtgagaaaggagggaaaat
tgtcggcgagccgccgtgcgcagtacaaatgcccgccacacagctgcaatctgattggtcgaaggctgcctggcgcggaa
ctcaaacttgtttcgttgcacgtcggtctgcagttcaactcgatcctttgtacgaacgacaagtcaggtgaaatgatgtc
ttctttcttcaaaaaacagctgacttatccaacgaacggcgttccccaaaccatgactgatcttaagaaatacgagggat
tttttccaaacatggctggagcgacttatgatcccatttcgcttattaaagaagcgaaaaatcttggtcacgaaccgagt
gctagtttttcgtcagattccacggctacttccaacgatgatgacatgttttcgaacactgcgtttgcgttctcaaggta
ctgattttgatattacttgaaaatgaggttacatcgaaaagatttttaaaagcattttatgcgttctgcacagtgcaagt
aacatcgttgcaaaagttagagtgtttatttcatctggtgtgagctcataaatattcttacctcggcgtatgtaaaattt
tctttccagttgctcggcgtgttgaagaaagagggagagagagagattttcttgtccgctcttttaccacgtaacgaaaa
caaccgagaaatagaagcatgagtaaacattaaaatgagaaactaagaagtggctaaattttacttcccttgacggaaaa
ctatgcataccagatgccgattgtaatgataagcattcatcgtaagcatcagagcgaagcgattacttaaatttttttcc
acaattgggtgtgattgcaaactaatttttacattgaaagacaagtctcaattttttttctggttgataacagttagttt
acttgttgtctttatgaattgttgtcaatcactgtaattaatttcaattgaacgttgatctttttatgcattcagaagga
gaattcgttcaaattgaaattgaaagttttgatcggtacagcattgtttgtacaaatgtacttggtttgttctttttaca
gcagtgatgatagcacaagatcaagccagacatcgagtgatgcatatgacgaaagcaaatcagcgttcctgaagacacca
agcaagacgccagcgaagcgagtgagtcccagaaagccacttaagccagtgaaaagtgtgaatccatgtgatccaagctt
caaaggtgttactttacacatgaaaacaacactaaagaaaggaaaacgagggctaaaaaaccgctccgaagcgcagctgg
ttatcgactgttgtttcacttccaggaagaaacgtcgttgttccaatcctgagttcgaatgcagcaagccatccagacag
aggctgtctcctgctgggttaaatccttccatttttaggctacaaagctcccctgattccttgcttaacgaaaggagttc
ttcagatgtggatctgggaatgatgacgcctattcaagttgagaaggaatgcgcatcgtgcggaactctcaaaacccctt
tgtggcgcgatgcagaagatgggacgcatttgtgcaacgcctgtggaatccggtataaaaagtacagaattcggtgctta
agatgctggtatattcccaagaaggaggagaaagctttgccctgttgcactagctgtggccatacctataaaatcaactt
gggtcgtaaagcggggaactcttttagcgctagtgagtaggattgaaattgtaaacgaaatagttgggttttattcactc
ccattcagttatattccatctgaacagctggaatacttggaaggttttacaccaaatcgacatgtttaggaaaggtgtag
ccaacataagatcgcaaga

Protein
Protein IDaug_v2a.09657.t1
Definition-
>aug_v2a.09657.t1
MNCVYFVALEEIRELKKTNVASRYLRQRKCFLEIDIRATYLSGRYFLLLAVYIVDKAIASGGGITEPLPEKKEASSHADP
IHHQYSHIGHTHKSSHKKRKHKRHRCEMIVRKEGKLSASRRAQYKCPPHSCNLIGRRLPGAELKLVSLHVGLQFNSILCT
NDKSGEMMSSFFKKQLTYPTNGVPQTMTDLKKYEGFFPNMAGATYDPISLIKEAKNLGHEPSASFSSDSTATSNDDDMFS
NTAFAFSSSDDSTRSSQTSSDAYDESKSAFLKTPSKTPAKRVSPRKPLKPVKSVNPCDPSFKGVTLHMKTTLKKGKRGLK
NRSEAQLVIDCCFTSRKKRRCSNPEFECSKPSRQRLSPAGLNPSIFRLQSSPDSLLNERSSSDVDLGMMTPIQVEKECAS
CGTLKTPLWRDAEDGTHLCNACGIRYKKYRIRCLRCWYIPKKEEKALPCCTSCGHTYKINLGRKAGNSFSASE*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495