Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.08522 |
|---|---|
| Locus | scaf3241 : 151246 ... 160731 : + |
| To GenomeBrowser | scaf3241:151246..160731 |
| Genes list of scaffold | scaf3241 |
Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.08522.t1 | gi|694839418|ref|XP_009460351.1| | PREDICTED: protein lunapark [Nipponia nippon] | 8.99999e-40 |
| aug_v2a.08522.t1 | gi|733895341|ref|XP_010712074.1| | PREDICTED: protein lunapark isoform X1 [Meleagris gallopavo] | 1.0e-39 |
| aug_v2a.08522.t1 | gi|733895343|ref|XP_010712075.1| | PREDICTED: protein lunapark isoform X2 [Meleagris gallopavo] | 1.0e-39 |
| aug_v2a.08522.t1 | gi|704272318|ref|XP_010154488.1| | PREDICTED: protein lunapark [Eurypyga helias] | 1.0e-39 |
| aug_v2a.08522.t1 | gi|543746993|ref|XP_005514268.1| | PREDICTED: protein lunapark isoform X2 [Columba livia] | 3.0e-39 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.08522.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.08522.t1 gagacaatttaggtttttcaaactcatttgccactgagtttttttaaatgcatttctgcatcttgaattctccaaaaaac acttgcttagtgagggtgggtaggtacttttttgtggggggagaggatgagtggactaacagtggaaggtgtgtggttga ttgtgggtggggtgtggatgtgggtgacaaaaatctccagattttagatctctagtggtcagcaccatagcatttgttac catgatgaagtggctattctaatgggagcagacatgttacttttatacacaaccgtgtaggaacaagcacccatatcaaa atccattgtttcacatagtctactgaacagcttaccttgtatgaatagtcaccatcatttattgttaaggtaaactgtgg tgaatattttacagtatagataacagaacatttttggaattaaatttctagtttctaaaggaactgtggtgctgcgttgg tgggagagatcaaaacaaaaatttagttttaacaaacgagttgataaaggtgaaattaccgccgtgaaatatttggaaag ctgatgtttcgagcgttagcccttcgtcattcgctctgacgaagggctaatgctcgaaacgtcagcttttcaaatctttc acggtggtaatttcacctttatcaactcgtttgataaaaccaactttttatttttggaactaatctgaaaacaaagactt gactttccaaatcaccagtcagtgttctccctaagtttaagctcagcaggtgagggacaattcctgactggtattttttt aaaacaacttatatagttttagtaaacctgcaagaggttgctggcagtaagaactgttgcttgaggtggtaaattttacc ggttactgcctgataatgagaacactgccagtacacgaaatcgttcttgttttgtttttgtttttatttttacagctctt tttgagtgctgcatatcaacattattattattatttttacccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcattggttctttagttttgtactccattttgctttatatt ttagcagctcttgtctgctacttttatgacttccctaagtcttggaaagctaaaattgtccgctcaattcctctccttgt atttcctcttgtgtaagtattacatttagttttgtaagacattattgtagcatcttttgtttgatctgtttaccgattac taaggatagaaaagcaagtttcatgactagtagtcacaacaagctggctggctcaccagtctgcaactggaatgccaacc ctgttcccagggggactcttcctcacttccagcatccggggaagggaagaagagagggaccctgggaatgaagttcaaag cacaacagttctgctcaactgagaataatatacaactattccctgaaggggaggtgaatagtggtggatatataccgaga tgcgaagtgtcaaggtatacatccaccgcccttcaccaaccctgagggggataattgttttagtatttaccaaattagat ggatgaaaaaaagggcttctcaatttcttcctctgaaacttttcgcgaaatgacacaccctttttctctccgtccgcaaa acagtgaatgtccaaggatattcatagttacagaagccaatcaaaaattatgcgcaaaaattgctatccactgatttggt aaataataatgataattatcattactgctattggttctggccaaactgatccagctttagagggttgaccagtttgatga taagggatgcatgatattcatgttacagactggttgacctgtctggccagacctgcttactgataaaaaagggttttggt gtactgtaaactttatttagtactgctatcattagttcttgtaatgactgtaataatatttgttaatttgataatgaatt tttaattcctgataacatttaaccttgaatatcgggggatcaaaatgtctgctattacttcatttccttctgttgtacat aaacagactgtcttgacaaatgtaacagaatatttctcttatctttaagctgagtggaagattgaattaagttatcctaa ccaaaggacaataattaattattggtaatggaaaatatagattatatgtgtttgagcaaggtgtgattaagcaagaagtt ctagttgatgtaaccatggcatgttaaatatatcatggattttatttccctgtaatctgtaacaactacttttgaccaga aaacattttgatatttcttccttgaattaaagaaaagtaaacttcttgtcaaaatttttcttcaccatagggtttattca ttgaagagagtgcttcattatgtctttgttagcaggatcagtaagaagggtgagtagctgtttttggtttatttaggttt aaacaaaggaggtccacccatccaggtattattgatattttatttcatgtcattactttgcagcaagaaggcttgaggag ttaaaagatagaaaaagacaagttgtaagcatagagatattcatctagtattaaatattggtaacctgtgacaaaatgcc tcagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgttgtttttaaggtaaagtgaaaggactttaacaaaatttgatatttattgtgtggt ctacaataatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttgggagtaaactaatgtatcagttttgcgcaatgtgt cattgtggcaataattagtttttaatgctgtcttaaaatgtccctaatcccaaacccaacaagcacaagtttgctttata tggtaatgtgcacttgatggtgagatcgactagtaaagcactctgtacttgtattttaagaacagctttcctaataatag aaacatttatgttgtttgttacaagatggaatatcactcactaagttgattttgttgctgaaggtggagaggaaaaatac ggcaccaacatctccagttcctgctgtgatgcaaagtccacagggtacaataggaacaggtcagaataggacaatgactc tggttgtttgtttcatcaaaactaaactttcagagtggatcttccatctacatgcataagcataaaaacttttgtgaggg ttgaaaagttgataggcacaaatttaaaaggtattgatgacaataaggaatcatgtgatgaatgcctgattttggtgtat aggtactgctttacttctgacctatcaagctctcaaggaactggctaatgatatcacaagttcatgtaacatctcataac aagcatcagcagaattgaactgcggcacattattattataaatcactgattctggtgtataattcgtttttaacttaacg tttttacaagtgacttgtcttttggtatattgaagccgaacatctaagatgcactgagcttgtcttaagctacagaaatt gtttttgtttcactctaacgatattgatgtttttggttagtaagaaatcaagtagttattactttttcattttacagaac tgaggcaaaggaatctttcatcaaagacagagagtccaggggtccctgcattacagcgcaccttctctgagccctctctc ttagagtccccagcacagctcaaccaatcacatgattcaagagtggtgaataggtctgttgaggtcaggagatccagcag tcttatggatataactttatcaaaatcaggtaccggtataagcatacttttcaatgattcaacaatatcagcaaatttgc ctgctaatcactagtcttttccctttggttaggaagggtgcaactcaatcggattaagcggaaagcgctcaaacatatat agtggtctttatttttgcctagctgtcaaaaacagaaggatataagttaaatccttgtgaatatagtcactttagcagtt gttgatgtaattagataagacattgagcctttttggggttttacaatgattgattaattgacgattcctatatgtttcat atcttattttaacaatggacaaactctttttataccagaaacctttgtaattttaaagagcattgatcaaggtaaaagca attcagcatttatttgtagtaagaaggttaaaaaataattattaacggtatgaaaaaaagaagagcaagaaagaagtagt gtttgtaataattgtgatgatcaataggtttaatgttattggtgttgtttttcatcagttttactcacggtctcttgtag ttgcttcacctccagcatcacctgctaagcaacagccattagctgctcatgtgccaatactaaagcttcaacaaccaatc ttaccaagagaaaggacagctgttgacaaggtttgttatgaaagatagaacggcattaaatgcacctgttgatgaataat gtaaatgatggttccttcgcaagtggttgaaagaaccactgaaaagatttcaaaattccagtagtcccttcacttattgc caagcaaccatcagttacattgaatactacactgtagagcccgcaattctagcggaacgctttgtgtgaagaagaaccca gtcaagggacctggctggctcaccaggagttcttgtagctcagtggttagagcatctaaccggtggtgcaaaggttgaag gtttgtattttattattattttttgttgttgtgtatatatatattggggtttagggttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnngtactccaaaaggaatctcttatgattagggaacaaaaacagtgattttgtgatatgccctgtaagtgaaactata tgttcattaaaagctgttgaatcatgaataaaattaaagaaaaaaaagggttgaagatttgtttcccacctggaactctg agatctttttagtggttccttctatcattgccaagcagccatcctttgcaaggtttgctttgtctatatgcacaagcaat tttctgaaaagcatgggcattattgatttcgcctttcctggtctttatgttcaggttatagaataccttgttggtgatgg ccccaacaatcgatttgctctgatttgctcacaatgttgttcacacaatggaatggcattaaaggaggaatttgaataca caggtaatacataggcaaattttgacctctcagtttagtatgttatgtaattagtcatttatttattcaagtcatattat ttttttcatgtctgtttatgttatactgtacaagtattaagctattctgtactgcactaattgtattctaaaaccaataa taattattatttactatttatgtgaatgtgtatagttatgtatttgtaacaattttatctggaatatatttgtaagaacg gctcgcctcgattagcttttgttaacatagtaaaacttaaaacttaaatttaaaactacctgttgtgaaaatctagtaag ggtcttttcgattttcatgcatttttatgttgatctcaacggggattctacaaataaatacattgttggtgaaaaccacg nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttttaatactgttttgcttcttcagtctcca aagcacggatcccaaaccatgggcgttaggtgctaaagagttcactttattgacagtactgttctgagaatgtgagctgt tgccagaggagtaattttttagaactcattgatgcctgggattttgtcaacatacttttccagtcccttcttaatggccc ctagtgcaccagtgacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagcttcttgtgcaaaacctgtctctagtttcaggtca gtcactgagtacaacatccacaattgtttgatagttaatgtcgctgtgaacttaaccctgctctcgatgttgaagattag gaaataaacgagggaaatcacttgaatcgtgagctgttgattgcgatggacaagagagtacaggacataaatgcgtgcgc gcgaaattcacaaaacacgcgtgcgactcgcgagaagctcttctctttttgaaatagtttctatgcattgctgtttgtgt tttatttctaatgcatgatgttgctagagagagtgatacttcattacaattaattgaacagctattaattatttattact attgagatgtaagttattttgtttagaataaatttaatgatcaaaa |
|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.08522.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.08522.t1 MHFCILNSPKNTCLVRVGRYFFVGGEDEWTNSGRCVVDCGWGVDVAALVCYFYDFPKSWKAKIVRSIPLLVFPLVVYSLK RVLHYVFVSRISKKARRLEELKDRKRQVVERKNTAPTSPVPAVMQSPQGTIGTELRQRNLSSKTESPGVPALQRTFSEPS LLESPAQLNQSHDSRVVNRSVEVRRSSSLMDITLSKSVASPPASPAKQQPLAAHVPILKLQQPILPRERTAVDKVIEYLV GDGPNNRFALICSQCCSHNGMALKEEFEYTVSKARIPNHGR* |
|