Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.08508 |
|---|---|
| Locus | scaf3241 : 41966 ... 48549 : + |
| To GenomeBrowser | scaf3241:41966..48549 |
| Genes list of scaffold | scaf3241 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| 60 kda heat shock mitochondrial | GO:0005524 GO:0005737 GO:0042026 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.08508.t1 | gi|156406520|ref|XP_001641093.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
| aug_v2a.08508.t1 | gi|196001855|ref|XP_002110795.1| | hypothetical protein TRIADDRAFT_54071 [Trichoplax adhaerens] | 0.0 |
| aug_v2a.08508.t1 | gi|260800325|ref|XP_002595084.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_115228 [Branchiostoma floridae] | 0.0 |
| aug_v2a.08508.t1 | gi|512942594|ref|XP_004910255.1| | 0.0 | |
| aug_v2a.08508.t1 | gi|524881471|ref|XP_005097387.1| | PREDICTED: 60 kDa heat shock protein, mitochondrial-like [Aplysia californica] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.08508.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.08508.t1 cagaagtttgatttcaaatacatcagtgagaaatctcatgcgatagtcatccaatttcaggcaaatatgagcaatctgaa aatggctgtcatctacttgatttgcgctgttttaaaacacgaaactctggttcccttttttttttgcaatccagacgcag attgcataatacccttgaattgcaagtagtttttcagtgtgattttagataaataaatgtattgtttgaaacataccaac aacatggggagatcttcttgtaatttaacattattactcattatctgttacttcttattttcagatgtatcgtctgccaa gtgttgtccgtccagctcaacagctattttctccaaggcttcttagccctcggctagcccaagcattcagtacatcacgc cagcaccaggctgcaaaggaactcaagtttggtcctgatgccagatctagtatgctgaaaggagtggaaatcttaaccga tgctgtggcagttaccctgggaccaaaggtttgatatttaatttttatgctgcaagttccctttttgctgttcattattt gtctagctttctttggagattttttattaatccaatgcttagtaacctagtaaggtgtaccttgcattttttggaagtgg tcagagaagaaaacaggagaataacaagatttaatatcataaggtgtattcagctatttataactgagcttttgttgggt attcctcaaccttggatcagacatacttccagggtggactgggtttgttgcagaatgccttgctgttgccaagtgaaaag tgacacctttaccttaattaaggcactctgttaaacatgctgtgtaaactagaggatccattagaaaaactggcataaag tcttggtagttttcaaatctctctagtaattcccaaaattgcttcacatttatgggaaaatgaagtaattaacaacaaat 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|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.08508.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.08508.t1 MYRLPSVVRPAQQLFSPRLLSPRLAQAFSTSRQHQAAKELKFGPDARSSMLKGVEILTDAVAVTLGPKGKNVIIEQAFGG PKITKDGVTVAKAIELKDKYQNIGARLVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLAQSIAKEGFVIVSKGANPQEVRKGVMLAVEA VVENLKKMSKPVTTPEEIAQVATISANGDKGVGDLISSAMKKVGKNGVITVKDGKTLQDELELIEGMKFDRGFISPYFIN TTKGQKVEFQDCLVLLCQKKISSIQQIVPALEMANAHRKPLVIVAEDVDGEALTTLVLNRLKVGLQVAAVKAPGFGDNRK NSLQDIAIATGGMVFGDEALETKLEDVQIQDLGEVGEVLITKDDTLFLRGKGDKEEIEKRCTEIREQIEMTSSEYEKEKM NERLAKLSDGVAILKIGGSSEVEVNEKKDRVTDALNATRAAVEEGIVPGGGVALLRCINSLDSVVTTNEDQEKGVDLVRR SLQKPCLTIAHNAGVDAAKVVVKVSSMEGNEGYDALNDTYVDMIQSGIIDPTKVVRTAITDAAGVASLLTTAETVVVEIP KEEKADLPGMGGMGGMGGMGGMGGF* |
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