Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.08507 |
|---|---|
| Locus | scaf3241 : 38107 ... 41025 : - |
| To GenomeBrowser | scaf3241:38107..41025 |
| Genes list of scaffold | scaf3241 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| 10 kda heat shock mitochondrial- partial | GO:0005524 GO:0005737 GO:0006457 GO:0009792 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.08507.t1 | gi|291235090|ref|XP_002737478.1| | PREDICTED: 10 kDa heat shock protein, mitochondrial-like, partial [Saccoglossus kowalevskii] | 2.0e-29 |
| aug_v2a.08507.t1 | gi|260800323|ref|XP_002595083.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_90193 [Branchiostoma floridae] | 5.0e-29 |
| aug_v2a.08507.t1 | gi|170596401|ref|XP_001902751.1| | chaperonin-10 kDa [Brugia malayi] | 6.0e-29 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.08507.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.08507.t1 tagtttctccgagacattgatgttaagtttgtcgtctgaaatcactgacaggattgcgtaagcttctcgcagaattgctc caatgcaagtgaattaagttctgtaatgatgtaataatttaatgtttgtttacttctcaggctagcattagaaaatttaa accactttttgacaggattctggttgaaaaattcctcccagaagtggtatgtttaattttcttgctatgttttgagtcta tcaataattatttaacatatataatatctctttgttttttctttcttgttttccaggagatttaatttctaaaatcagta tttttttattttctgattttgtctgtgtcatttcttctagaagatggttaggagcaattttagaacacccatttatttgc agtaccttttgccctttatgaacaagaagaagataacgatataattatctggttatatgccaataagtattattcagggc tgcaaataacggccggtcaacggacaatgtctggtcaaaaagaggtattgtccggtcaaatccttagatggccggacaat ttgtccggtcgtttacgctggtaaggaaaaaatttagagtttcaagttttaagtatttaaaggttgaatattattattat tattatcgatttttgtccagccaaaaatgggatatgtccgagcagaaataggtttgaccagacaatttgaccggcgtcag ccgggaaattatttgcagccctgttattaatatatacgtgatgggtattctgaaatccatctgttggagcgacagtgatg atctagatgagcaaagtcctgagaaaagctgattttgtagactgacatttcatcactttactctgaaaatagcattcact tttgttgtcaaaatgtcattcaacaagaatgatccttctcagaacttcattcaagattccattaagactttgtcccttgc cccttgtaaaccccgcccacctcccttctggaggagtcttacttctacctcatattgccactgggagccatactctctct tgctatttttattttctaagtgaatactaacagagtttgtgctttgaactttaccattatctttgtttttgattttttgt tatctatagaaaaccaaagggggagtgcttcttcctgagaaaggtcaagggaaagttcttgaaggaacagtagtagctgt aggacctgggctgagagatgacaaagtaggcaaatctaaaaaattatgtagtacctgtaaacttggattaactcccctgt atgacataatatggatgttgcaatgaaattggatgttaactgtaacataaactacttaaaattaagcatggtatgcctgc tggtcctgtcttgttcctatgatgtaactgtggtgtatttctctatgtgcacatggctgtgcatgtacaatgatgtgtaa tgtgtacctgtcagcatctctgtaaaggttaaacaaatttgactttctgctgtaaaagttttgatagtgagtgttacaga agaaaccaagaaggagctgtcacattttactattagctaaatgaaagtgatttagccatgttgtagacacagtagcctat tcagtcaataatcgcacctttagtaggggtgcatattgtgcctaataataattattactgttacaagccattttagtaca ttttagtaattttttactgagatcacccatatcatacatgttgtgacagtttctctgggagatttggctttgaaaatacc tttttaaggtaatggctgttagaccttgagacatgctttctgacttaaaaaacacctgaccccagctgaaggagtacaga attgatggtctgacaaatgtgaaatattgatgtaaattttgttttccagacaggtgaaagcaagggggtgagcgtggaaa ttggagacaaggtccttttacctgaatatggaggaacaaaaatcaaccttgaagaaaaggtataactatttacatttttt ccttctttgcacctaagcaattacttccagattagcatgtcttcaagagaagtaaattctgctagtggcttcataccaac atgggaggtagaaaagaaaaagatgtcttaattaaccattcactgatgatgataaacagagtgacaaataaaagcatcct ttctgccacagctcttaattttatttggctaaaaggttgctgtaaacagttaaagattagccaaggtaatcactggaaac tttgaagattcacagttaacataccgcagatcaataagcaagttctttggttaatttggtaggttggttacatttaatga ttaattttttgtcgtaatagcttacatgattgccaacaggtgaagccgataattcaacttaaacctttttgaccttggca atctaaccatttttaagacttttttctcttttgtgttccataaaatatttgctaccattaccaagaagtaatattgtggg ggaagcaatagtgctaatcggcaccattaacatgctctattaaatttcaaatttatttggttctcatttcacgtcaatat tatgtactctatagcatcaaaattttggaaacagctgtagtggctgtttgactagaaagttgcagcttaaatgctgatgg tgaaagacaaactttccctttactgcaactgtggattataagttaagtttgttagaaggggttggttcttgattggacca atgataaaaaataataacaataaccctaggtaacagtgttagtttcatagcttctcctttctgtttccttcttaggaata ccacatttatcgtgatggtgacattctcggtgtgtttcagtaggagggggactgactttggagaattccaacaatgtcat ccaaagagaagaacatgtgcatggatgattaatgccctc |
|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.08507.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.08507.t1 MLSLSSEITDRIAILVEKFLPEVKTKGGVLLPEKGQGKVLEGTVVAVGPGLRDDKTGESKGVSVEIGDKVLLPEYGGTKI NLEEKEYHIYRDGDILGVFQ* |
|