Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.07644
Locus scaf2878 : 170695 ... 176375 : -
To GenomeBrowser scaf2878:170695..176375
Genes list of scaffold scaf2878

Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.07644.t1 gi|115751577|ref|XP_789550.2| PREDICTED: SEC14-like protein 2 [Strongylocentrotus purpuratus] 1.0e-08
aug_v2a.07644.t1 gi|390338781|ref|XP_003724846.1| 3.0e-08
aug_v2a.07644.t1 gi|390365074|ref|XP_781560.3| 6.0e-08
aug_v2a.07644.t1 gi|156379172|ref|XP_001631332.1| predicted protein [Nematostella vectensis] 2.0e-07
aug_v2a.07644.t1 gi|145486828|ref|XP_001429420.1| hypothetical protein [Paramecium tetraurelia strain d4-2] 2.0e-06

Transcript
Transcript IDaug_v2a.07644.t1
Definition-
>aug_v2a.07644.t1
atatatagttctttccgggtctttgttcatcgatctcgagatcactgtctttgttgactggttgtttgtaacgctgttgg
ctttttgcatcacttccatgatagagttcgcgaaaaccgtcataagtcgagaagaaatcgacttttcatttgaagaaagg
caggggtatttcgtttatcatcctttaagaaaaagtttaagcgatcatattccaggtattctagtcttgtgatattagct
cattaaaaaactgtacaaaatggatctagatagaaagactatttcatagttttcctaagcctatagagttcctttttcgg
ccaccaggtcgatggttctttcgacaaaacatccttttaggctttccttcaacttgttctcatgttttggattacagatc
atattgctaatttgtttgttacgtataagtcacctggtctgttataactaaagagaaaaggtgatttttaaattgtggtt
cataatgtaatacatctctcagattgagtgttgagattcaacactgggaacttgtctaagcttttccctcccgtaagtgc
caattggcactcatagattttactctgtctaacgccagacgattttacttgtcaatggggaaccccttgggtgggaaagg
gttaacaacaacatcatcaaaaactgtccccatttaaccctttccctcccgtaagtgccaattggcacttcagtacagat
tttactctgtcaaacgccagacgattttactcatcaatggggaacccttgggagggaaagggataatgtatgnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcgagaggaataactgtttt
agtaaaatccaactaattgtcaaaaaaaaatacgagactaaacatctttcctaagttaaagctagacttcaatccttttt
accgccaaaacattacaaatatggcaggcgcttttcgctactagtgggctataacatatagcctactagtagctcaacca
atcagaacgcagtattgagaatagaccactagttggattttactaataacatatagcctactaggagctcaaacaatcag
aatgcagcattgatgatagaccactagttggattttactcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctcttgttcttgttttcaaatgcccatcatggtttatcacaatgtaattca
ccacttaggcttcttaatttgttagatatagccaatttattatatcaaaaattacgcactcatgcacctataatccaaaa
tcccagaccttgaagaaatgaatagcaactgatgtcttgcattatctcatgttaactgacttttctttttgttttttgtt
ttttaatctgaaattcaactttgacagatggttgtgtactgcatttgttgaatggccagcccgtttccaacattggtttg
catctcagcgacatttatgattacatgtcttggcctgatcactacccattatctctggtggttggatcagaacagggatt
acaagatttgaaagacaaaaaacgattaacggttggataaataattttctgttctttagatcaagagtatgggcatgtga
catttgatggcgtaaggatcttctctgaacctgaactattctaattcagttaccaaaaactaatcaaatgtgacaaaact
tagtgaggttttcaccgtcctcccataactgattgacaagaagctgcaatgaatctcattcaagcacttctcaagagtaa
catttaccttttgtttggaaagcactatgttataaataattttttgttgaacgatttctagtgtatattaatttgtgact
taatattattttaatatgccataaaacagaaacctgtaccatatgatttctttggggagataccaacattaacacaagaa
gatattaagcattatacaagccttgctcattcatgggttaaaggactgcttgatgcaaccacagatgaggtaaaatgata
atgagacaaaagaactcaggttccctcataagcaatatataaagtaagtttactgtactttctagttaaaggtgaatatg
tttatctctattaattgtttgctccccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaattcaaccatctgtcagatttaacacttccacaatagtaaagcaaat
ctcattttgcttttgcatctttttaggttacttatattatccaagctgatcccaaaggcttcattcccaaatgggcagtg
aacaagtttgcatggcagcaagctctaaatgtagtacggataaaaatgttaatagaggtacaattcagtgatttatgtgt
ttcaaatgaagcaaatagcttttaaatttttattgtggcattaaaatggcattattattagtattttttcaattatttac
cttttgtagggtaccctaaaagcaaaggaaaaaatggaacatcaagaaagaaataatggttggtaaattaggcaagaaac
caaatctcatccctcagttactaaaatcatataattttagtctgaaatggcccttgataatttgtttgcagctgaagttg
tgggttttgtggtgcccaaaagacaaatacacaaagttcaaattcaagtaaccgtacctaactcaatgattctgtttggg
ttttgctctgaacaccatgatattgggtatgtatagtcatcgaccgttgacacagacattatgcaagaaggacaaaatca
caacagacttgataacaaaatatgttggtttctctgtaggttttttatctcaggtttattaacagagcaagactggagca
aaacaaagaggttcgactcacatgtctaccctgtgaatggacaggtgtgttaaaaaagtttacaatgtatggttttttaa
ggttgaaatttatccctaaaaactgaaatgagctaggtgccacttcaaaaaattaaaatatgttgatgtttctaaaccca
tcagcttgaactttttttgaacagaaagagaaatatttaaatcatttcattgaacattgaagagaatcagtaaactcagg
tctcaggtattgaacccgtgacaatttaagtggaaggcaaatgctaccaccgctacggttaatgtgcttctgtctggcta
tgacagtctccttttcccttcctttcttttttcaggtgttagttgatgcagggcagtacgctctggtctttgacaatcat
tacagctggattagatctaaacagatttactattggtatcgagttgatactcaaagctgccagttttgaaactggtagaa
actttagttacccgactaatttacaaccaatgcaaattttggttttgcataaagagattaaaagaaagtagctgatggta
a

Protein
Protein IDaug_v2a.07644.t1
Definition-
>aug_v2a.07644.t1
MLIEGTLKAKEKMEHQERNNAEVVGFVVPKRQIHKVQIQVTVPNSMILFGFCSEHHDIGFFISGLLTEQDWSKTKRFDSH
VYPVNGQVLVDAGQYALVFDNHYSWIRSKQIYYWYRVDTQSCQF*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495