Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.07641
Locus scaf2878 : 157816 ... 162133 : +
To GenomeBrowser scaf2878:157816..162133
Genes list of scaffold scaf2878

Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation GO
protein disulfide-isomerase a6 GO:0003756 GO:0005783 GO:0006457 GO:0034976 GO:0043277 GO:0045454

Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.07641.t1 gi|156372789|ref|XP_001629218.1| predicted protein [Nematostella vectensis] 0.0
aug_v2a.07641.t1 gi|390336453|ref|XP_790496.3| PREDICTED: probable protein disulfide-isomerase A6 [Strongylocentrotus purpuratus] 0.0
aug_v2a.07641.t1 gi|151553573|gb|AAI48887.1| PDIA6 protein [Bos taurus] 0.0
aug_v2a.07641.t1 gi|329744598|ref|NP_001193274.1| protein disulfide-isomerase A6 precursor [Bos taurus] 0.0
aug_v2a.07641.t1 gi|426223138|ref|XP_004005734.1| PREDICTED: protein disulfide-isomerase A6 isoform X1 [Ovis aries] 0.0

Transcript
Transcript IDaug_v2a.07641.t1
Definition-
>aug_v2a.07641.t1
gagaagccggccgctttgattcctccgtggaacccacgtcagatttcgtttggtcttattgttcgttgtatcagaagctg
tttctgctaatattcttccaattcttcaacgatgaggcttatttacggttggtttaatccttcatcttcgcggtcgtagt
gttagttatggtcgctaactaaccttattttggttattttctaggtatattgtgttcttgtatggtggctttgtgcagag
cactctatggttcccacacggatgtcgtggaattgacagcaaataattttaattctctggttatggatagtgatgcagtg
tggcttgtagaattttatgctccatggtacgttataaaatcctgcttacagttcatagcttggcccaagttcaaagctag
cataatagttaataacttcgaaacctagaattaaacatccaaaaccattgaaataattttggtcctgcgctgaaggatgt
gtactaatttgcgttttcttgcattgatcctcccagaattgcaagtaaatcacttaaaaattggaaaagtggaaaaattc
atttatctgtgaaaataatctaataaacctttatagcagtgcatctctcaatctctagcaataaacagaatgtaagaata
aaacaggttcaccaccagacccttctgttcatggccaaaaataaaaggaaaccactacaataacaaccaattaaaccaaa
aacagtgaaagtgaatcttggtgcatctagtgtttcgcatattggtctttccgaacaaactgtatatcaggcctgagttg
ctcgaagcatggttagcaccatccattgttaacttcctcagaaatgtattggttttgatacttctcaaccaatgggtagt
gccaactatgctttgagtaacaagccccaggtcattgttggactgaaactcaagcaaaggtaataacttatccatgagta
ggcagtaagctgagcaataagggtgcaggacatgaaattctataataccagattcaagttcctcttatggccagctggat
ttgttgtgggcatgttggtactgacatgccctccattggtagggtatatattaacaaaaaaaattattattgtcagaacc
tattgccaggttgagtatggcatgtatttgtgaattaatcctgaaggcttgaatttttaatttaccgaaaagaatttcaa
atggttcagaattgatataatctcaatgcaactctaaccctccacctcaaaaattaatttcactttattgattgtcatta
attttaaaggtgtggacattgtaaagcattggctcctgaatggaccaaagcagcttctgccctcaaggttggacagtgtt
tttgtgtgtctatctcacagcactgataaatctgtagatatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaagtcaaaattta
agaattaacatcttttgtgtgatttcatgggaacaaagcttcactgattgaactgccaagcttttgagactcatgaaaac
aaaaaacataccctgagtattaattattgttcaaccaattttcctcaaattaatcttgcatgttagtacatttaaactca
agcagtcacatcccagttggtaaataatgtgatcgttatgatctacagctgcagcttttttaacacaaaagcatcacaac
aatcaaaaacaagagacctgtgattttgatggtatgcattgtagaccttgaggaccaactgtttatggttcaatttaaag
tagtttcaacccagaggcacagatttatacagtgttatttgttgagagatcttaaatctctttcatttattgtttttacc
ttggtgctagggcgtgataaaggttggtgcagttgatatggacaaccaaatgaatcagcaattaggaggccagtatggga
tcaggggattccctacaatcaaggtaaagcaaatcgattaacactggaatactgttctgtgtcctaccactaaaactcat
gctttattaatgagctttctatatacccaaaccattctaggtttttggatccaacaagaacagcccaaatgattacaatg
gtatgtgcagttgaatattgatgtctttgtttgtttcattccacttgcacacacagacattcttgctattgaagaacatt
taattttataggtgctagaactgctcaggccattgttgattctggtttaagtgcacttaaatctatggtcaaagacaaac
tttctggaggtgggaggagatctggatccagtggcggaaaaagacaggtacgtatgcaatgattcccaattttgaaccag
cgttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtgtggtcaagtggtaatatttgcccaggaagctccactcacacc
aaagtggttttcagggaggtcctgcatgtagttgaattgaaatttggaaatgttgttttttggggagagggaaaaaccag
agaatccagggaaaaacctcttggagaagagtaaagaaccaacaaccaacttaacccacatatggccaggaattcacaag
gaagatccttgactgaaatggcattgggttagttaaaagatccaccatctacagcaataaagttaaattattattcatag
tcatgcctatgcagttggtgctacacatttatttttaattttcaattgcatgtaccaagatcagttgtatttaagacttg
tttaattaagagttagctgagacaactttaagtatcctttaagtattctgaatcagtgatgaccatttactatatttact
tactatttcaatggcccaacattgtgtaaaagtcaatatattattcttataatcatgactatgatgatcttattttttag
gatggtggaaaagctggggatgaaaaggatgtaattgagttgacagatagcaattttgaaaaggaagtactaaatacaaa
ggatttggttcttgttgagttctttgcaccttggtaagtactttttatattcacaaagaagcaagccaattctaaaaggt
caggaacaataagaaactgcccagcagtttaagtattgtggaagaaccctacatgtagctcattctagaaggtgaacaat
gttttcttgaaaccacatgcaaaacaattcagaggtctcaagtgcatgcatactctagtctgtgtttaaatcaagtcttt
gttttgctcaaggtgtggacattgtcaaagattggctcctgaatgggcaaaggttgcaactgagctgaaagggaaagtca
aagttggagctcttgatgctactgttcacactgtcaccgccggcaggtatgagatcagaggatatccaaccattaaggtg
ttcagtgcaggagcaaaagattcccacagcattgaggactatcagggtcctaggtcagcttcagatataattcagttcgc
tttggataagcttgcagattcaattgaaccaccagaagtgttgcagattgtaaatagtcaagtggtaaaagagaactgcg
aagaaaaaccaatctgtattgttgctgttctgcctcacattctggattcaggagcatctggacggaatcagtatctggaa
attatgaagtcaatggctgagaaatataagaagaaaatgtgggggtggatctggagtgaggctggttctcaatcaaaact
tgaagatgctcttggtttaggtggatttggctatcctgcaatggctgctgtcaatgcacgtaagatgaaatatgccactt
tgaaaggaccctttgacagtgctggtgttgatgagttcctgagaactgtatcagttgggcgtggctccacctcacctgtc
aaaggtgcagctcttcccagtgtagaggaaacagctccttgggatggcaaagatggggagttaccagtggacgaggacat
tgatttatctgatgtagacttggatgaagatgaaggcccaacaaaggaggaattgtaaccatatctagcataaatcacac
acttttgtgctgaatagacagtatttcccttggaaggttgttatttgttacatacatatgaaaagtattccaaacatctg
aaacacagctttgcattcactaacacactatgaagtaaaccagttaagagctgtgctagatccaatggctgattttacca
agcgtagatttttatcagttgttataccctttcacaatacagtaatgtaactgtccaattaaaagatgaatttatacgat
tttgtgatttttgttgtatcataaaacattttagtcttaagcaacatgaattttctgtaataattccctttcttgtaa

Protein
Protein IDaug_v2a.07641.t1
Definition-
>aug_v2a.07641.t1
MRLIYGILCSCMVALCRALYGSHTDVVELTANNFNSLVMDSDAVWLVEFYAPWCGHCKALAPEWTKAASALKGVIKVGAV
DMDNQMNQQLGGQYGIRGFPTIKVFGSNKNSPNDYNGARTAQAIVDSGLSALKSMVKDKLSGGGRRSGSSGGKRQDGGKA
GDEKDVIELTDSNFEKEVLNTKDLVLVEFFAPWCGHCQRLAPEWAKVATELKGKVKVGALDATVHTVTAGRYEIRGYPTI
KVFSAGAKDSHSIEDYQGPRSASDIIQFALDKLADSIEPPEVLQIVNSQVVKENCEEKPICIVAVLPHILDSGASGRNQY
LEIMKSMAEKYKKKMWGWIWSEAGSQSKLEDALGLGGFGYPAMAAVNARKMKYATLKGPFDSAGVDEFLRTVSVGRGSTS
PVKGAALPSVEETAPWDGKDGELPVDEDIDLSDVDLDEDEGPTKEEL*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495