Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.04427 |
|---|---|
| Locus | scaf1635 : 62816 ... 67190 : + |
| To GenomeBrowser | scaf1635:62816..67190 |
| Genes list of scaffold | scaf1635 |
Manual annotation
| Study field | Autophagy |
|---|---|
| Gene name | ATG5 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| autophagy protein partial | GO:0006914 GO:0008015 GO:0009605 GO:0031400 GO:0033043 GO:0034045 GO:0043231 GO:0044710 GO:0048513 GO:0048869 GO:0051046 GO:0051239 GO:0051649 GO:0051704 GO:0060341 GO:0065008 GO:0070925 GO:1902589 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.04427.t1 | gi|156365666|ref|XP_001626765.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
| aug_v2a.04427.t1 | gi|585697370|ref|XP_006822372.1| | PREDICTED: autophagy protein 5-like [Saccoglossus kowalevskii] | 0.0 |
| aug_v2a.04427.t1 | gi|260789538|ref|XP_002589803.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_115265 [Branchiostoma floridae] | 0.0 |
| aug_v2a.04427.t1 | gi|723546383|ref|XP_010296574.1| | PREDICTED: autophagy protein 5, partial [Balearica regulorum gibbericeps] | 0.0 |
| aug_v2a.04427.t1 | gi|611997729|ref|XP_007484450.1| | PREDICTED: autophagy protein 5 isoform X3 [Monodelphis domestica] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.04427.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.04427.t1 gtcacagtggaacagccagatccttactacgtacgcagttgtatcttagatgtctccactggggaaaatttttagcattt tagcactgatgccttgagtggcatgtgaaaactaagatttgatagctgagatacagaaaggtttcgagtgcatgcttgat gaaataattccgccaaaaacgttaacacatagtctttttgcgcgcattctgttaggtgaatattggacaccaccttgtaa aactgaatgcgcgcctaagggacgacccatggccatttttagacccccaggcccgaacccgcacgtaattatcttgtaat aatatgcacgatttaccaataggccatttcggaaaatacgataatactctttgttttttcttgggaccattgtaagtctc aagagaaactagaaacactgcttatgcaaaattttgggggacaaactaagagtattatcgtattttccgaaatggcctat tggtacgtaatgggtattatggtattttccgaagtggcatgtgccaagtaaattcaacacgactctgtacacagactagg tggcttttcctcagggcttagccacaaggggttttatttgaattttcgattacaatatttgccaggctaatagacatctt ttcggagtttgccccaaaacctttcattgaattatcgacacataagcttggtctttgctgacctatagggaagatatctg tttacaaacacactgattttgttattcaaatgtgccaaccttaggaacaaaagccccttgttttgacagccaatgagact ctggttggcacattaatgaccaaaggtgatgccaatgatattttgctgtagatgtactctgcacataacgatgtgtgtcc tatttgtattctgtggacattatgtttcattttttagtggtgaagtaattccagacaatgcttttttttagcttttggta ccaagattgagttacttaactcttgtgactgacaaagtgcagcgacatttccaaagggctatccacaacgaaagtgtgga tgaaatgtggtttgaatacgatggtcagccattgaagtggtaggtgaaagataagtatcactaagaagaggtctgtttgt ggttattggatcggttatttgagaaatacagtaactaatatcatccactctgacgaagggctagcgcttgaaacgtctta aactttgagggtggtaatttaatgtttatcaacttgtttgatcaaacccaatttatgataccattgctagtttgtgtggt tgaaaagtagtgatcctccctgatattactctagaagtttaagcatcattggtgtatgttgttgtcccgaagttaattct actcccgtgatgtcaaggtttgcctgggagagcaacatcactcgtttcattcctctataacaatgattattattttggct tcatatattgtaattaccccaagaattgtcagacattgacagagtttgatatttccccttggagactgacagctatccaa tcttgactttgtgacataatcattggcaatttttgttgttacctcaggcattatccaattggtgtattgtttgacctgta tggctcttcagcctctcttccatggaaccttacagtacattttcaggtaatgaaggttgtacactcccaccttgtaataa taatactaaattgttttaaggatgtggagtgctatttgctggaaagttctctttcctcgtgtgggtgtacttttgagatt gatgataagttatgcatggcatctttgcttaatcattgcttgcactttcttaatttattgctataattatccacaaggta caaatattttatagaaatgtgatattttcctgttgtggatgacactatcaacctttggagttcaaacatctgggaccagg ttattttactcttctataatccttaatgacttaacacaatatctttcatttaaattgatttttgaacagaaatttccaga aggcaaaattataagatgtcctgggaaggaggcaattgaatctctgtttatgtctgcagttaaagaggtaactacagcat gcaaggtcattgcaatgaaaattaacggtttgaatgtcattgcaccagtattaatattttttgaagtagttattgaactg catttccaaaatgcatgctattttttattataatattgtaaacagtactacttaaattttgggctcacttttatcatctt aatactctttttacttgaaaacacaggctgataatttgaaacaccgatctcaagtaataaattcaatgcaaatgaaagac cataaacaactttggctgggcctttgtaatggtgagtagcaagtgacaaacttgactgacttgcaccagaattcagttcg tagaattctgcaaatgatatcacttcatttatcagaagtgacagggcttgtaaagttgtctatttaagcagtacaatgca tatatatatgggcttaattcaaattcatttttattaccaaattgattaccagatttgttttacccacagataagtttgag caattctgggctgtaaaccgacgcctgatggagagaacaggagatgaccctttctttaagtttattccatttagaatatt ccaggtgagttatttgaagaaattagactccatctattgtttgtctttgaatgaaaagtgaacttctttgttacagacaa taaattatgggggaggtgagggatactttacagacatccctgctcacaaactttcagtctgacttaaaaatcaattgact ttgctagggtgatcccggtgctgtggctgtctttcctgacctagagggccatgtgttagaaaactccattgggttaacat gtctataccctctttaaacaaagataaaacttgaaactcgaaacttaatgtaccccacctgacagaatttatttataatt attgcttcatggaggtttcaattattgtacagaagccaagcattgttgtcttgttataatatttcaacataagttctttg tatcgagtttttacattatgcagtagcagagtcctttttttcttgttgttcaacatatcagttcctttcaaattgttatt gtcctcttttttgcttcaaaactctctggttttaactttttagctgttgttaagattgctataaatttaaatgatcatgg cattgtctcactttgaaccacatcatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagctgttagtaagtgtcagttgcaact atgatgactttttgtggtgaaggggggtttgaattaaagcattttctctttggtgcttgttttatgttatgatatgtttc gatcatattttctttgataaaatttcagtcagattatcccaatcagtttattcaagagctatacaaacctctgagaggaa atggtgagttttcttattctgacatcatgtttgataagttattacatattttgagtttcttttaagtgaaaagttgacat tagaaacttttgcaagactaagattttgcaacattgttacatactcttaccaaccgagttagagggctgtactgtgagtt accaaacagggtttgtcacttcaatttatgggcccaagtgcttcacactagggccatggatcaaaatggaaaaaacacag tgccataattaaccgtacagactaagaaaacaatgttagtaagatgttttttatatctattggaaattgaatggagctgg aaagcacaccacaaagtcaagcagtctgtcctttggaatacagacctctaaatcaaccaaattatcacagtgcatgcagt acctgagatctaataaataattttagttttctttaattgaatgttattcctttactttgatgcaatatttgctcaatata tatgttatcaatatagacatttaaaggcaaatactgtctcctgtttgtttgttttttatacacctgtttggatttgtgtg cattttgttacagtcaccatcagtgggcccttgcaaataagagagtagttttgtaacttgttctcccattcttgtttttg attgacaggtgagcaaggcactttaagcgacctgttgcgggagtttgttcctgaagtgttttctagtagtggtggagtgg ttgatactgagtggcgggtagttattcaaggtgttgagcctcctctggaaactccagttcattggcttagcgaacacatg agccacccagacaatttcttgtacattgttattgtgcatgcagcataataactttatccaaagccacagtcaatttctgt ggagttttcagatgtttgacaagggaatttggagagtgtttataacttgcttcag |
|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.04427.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.04427.t1 MSAVKEADNLKHRSQVINSMQMKDHKQLWLGLCNDKFEQFWAVNRRLMERTGDDPFFKFIPFRIFQSDYPNQFIQELYKP LRGNGEQGTLSDLLREFVPEVFSSSGGVVDTEWRVVIQGVEPPLETPVHWLSEHMSHPDNFLYIVIVHAA* |
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