Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.02368 |
|---|---|
| Locus | scaf779 : 140425 ... 148867 : + |
| To GenomeBrowser | scaf779:140425..148867 |
| Genes list of scaffold | scaf779 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| reticulon-like protein | GO:0016021 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.02368.t1 | gi|156352996|ref|XP_001622866.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
| aug_v2a.02368.t1 | gi|676431731|ref|XP_009046346.1| | hypothetical protein LOTGIDRAFT_230377 [Lottia gigantea] | 0.0 |
| aug_v2a.02368.t1 | gi|269784987|ref|NP_001161645.1| | reticulon-like protein [Saccoglossus kowalevskii] | 0.0 |
| aug_v2a.02368.t1 | gi|524876945|ref|XP_005095181.1| | PREDICTED: reticulon-4-like isoform X4 [Aplysia californica] | 0.0 |
| aug_v2a.02368.t1 | gi|524876941|ref|XP_005095179.1| | PREDICTED: reticulon-4-like isoform X2 [Aplysia californica] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.02368.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.02368.t1 agtgtaattttgaaaatatcggagaaccatcatttctaaattttcccacatttctcattatccttgcgtaatattcaatc tcctagactttgttgctcaatataaacctgtctttcaggtgaattataagcttaagtttctcttagatatttctcttaaa aatggcggattcaaatgtctcaggcacagatgaaggcaatttgttggatttcgatccagttcccagcgaagatgtttctt cgacaacaccacctatagacgaaccaaagatagaggacgaattttcctcaccagctgaagaaaacgaacgggatgaaaaa gaagaaacgcctgctgtggaagatcttccgacggtgaaaacagattcagatgaaaaacctgaagattcgacttctacaac taaaggttatcttgtttgtttttgcacgctaaaaaaatcctctgtcacgaggttgacgaatgcgcctaaaagagaaaaaa gatcttgtgcgacgttcgtgttgaagatatttgcgttccttgcgggaaatcaaaggcttgagcctttatcgttttgtgtt atatatgccttcgagcgaggtgaaatgagtcacttacgttcaaaggggtcttcgtgaaagcggtcttcaatcgtttttgt ctgttacagagctcacgagctggccagcgatatggatgaaagaacgtggagttgatcaaagaggtaatttataatttttg tacaacttgaaggggaactgaaactatgtacaaattgttttgttacatgtgcttcctaactctagacatgaacaaacgcg ctaagctcgccgagactacagcttatttcagtgatgaaaaaaattgacgaggaactcaagatgagtctggagtttttgaa aaaccgcgagatttcgaaataactacgattgaaggctttaacttcattatcgttgattttatgttttgtggaggggcgct 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|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.02368.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.02368.t1 MADSNVSGTDEGNLLDFDPVPSEDVSSTTPPIDEPKIEDEFSSPAEENERDEKEETPAVEDLPTVKTDSDEKPEDSTSTT KELTSWPAIWMKERGVDQRGIDLIYWKCVKKTGVFFALALVLLFSLTMYTFLSVVTFFSMALLTVSLLYRVGMTVMGAIQ KTGTDNPFKTILEKDVDIPKDKAVEVVEACVDQINCLTKELKRLFLVEDIIDSIKFGLLLWVLSYVGAWFNALTLLIIGV IILFTIPRLYEDHQDKIDQILKQARTQICALINQAKAKLPAKLQKQKAS* |
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