Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.02365
Locus scaf779 : 125513 ... 130579 : -
To GenomeBrowser scaf779:125513..130579
Genes list of scaffold scaf779

Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.02365.t1 gi|156381928|ref|XP_001632307.1| predicted protein [Nematostella vectensis] 0.0
aug_v2a.02365.t1 gi|72015529|ref|XP_780937.1| PREDICTED: tubulin-folding cofactor B [Strongylocentrotus purpuratus] 0.0
aug_v2a.02365.t1 gi|260831150|ref|XP_002610522.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_275787 [Branchiostoma floridae] 0.0
aug_v2a.02365.t1 gi|291243710|ref|XP_002741744.1| PREDICTED: tubulin-folding cofactor B-like [Saccoglossus kowalevskii] 0.0
aug_v2a.02365.t1 gi|148231492|ref|NP_001090127.1| tubulin folding cofactor B [Xenopus laevis] 0.0

Transcript
Transcript IDaug_v2a.02365.t1
Definition-
>aug_v2a.02365.t1
acagtcacgaaaacaacaatcaaatacttcctctggtgtcaggtgttccttcaaattgaacaaaaaagctagggattttt
ggcaacaacttgtcccaaaacggcacaaatggcgagcttttcaacacctagcgtagtatctgtacagatatctagttcaa
tgacttctttcacggccgaaaagaggctcgaaaaaggcgaaacaataacttctttaaaggtattctatgatgtgacattt
ttccatcacattgcaactttgctgtgatttttttagacgttatttgtttgtcgaactgcggtgatttgtgttagccaaat
attcagactgcaaaaagatgttggcttcatcagctgaatggtgaatctcatcaacttttcattaattttggttatctctc
aatattaattagtattctaaagcaagtattattcaagcgttgttgatggtagccgatttggggtttcatcggttagtctg
tctgtcgatcaatcaatcgatcccactggtcgcttggtgcgtctgtttgtttgttagctatatttgacaaggattactgt
tacgaagcccttcagtgattctgagtgagagttgtgcacaaacaaccagctgcattaatttgttttatgtagtaaattct
caggtgcacttatatttagcccactggtcttgcagcctctttccagttaggtgcgttttctgtttttttctttggtcccg
aaaagccacagtgggggcagtcaatgaagtgtgtaagtgtatgtcaaccaatcaatcaaagagtcttcgacttaccatat
ttacccgtgtataagtcaatcccgtgtataagtcgacccctcattttggagctaaaaaattagtttttattatttctggg
ttagaattttcttgaaaaacttatcttttatcttagaattttcttcaaggtacgctgtggttacacgaaaaatttatcct
gaactttttttgatctcagtttttgacccatatgtaagtcaagggtgatttttgggaccgattttcagggtgtgaagcag
gtcgacttatgcacgggtcaatacggtacacttgcttggtgcttgttggcagaaatttagccctgttggatgaaagtgat
gaactggatgggtgaatcacaaaaatttggtatctaacaagttggtaaatatcaaattcccatcttccttgtggcaaatg
gatggttcaatgcctgggaatacctttaaccccatgctgtactccttggggattgacaggctggcattaagttaccatca
tttgcatgtcacatagctctcaaaggttttcacattttatgtaagcatgtggcatgacccagatggttagttgtttttta
atccttgattgttctgtgctagtctctttaaatttaagtcttcatcttcttgttacagggaagattggaactgattacag
gttgctcagcaatgacaatggaagttcagttactggacagagatggaaagtttttgtgcattctcaacaacgacagtgct
ttgttcggtgcttatcctgttgaagacaacatgagactacatgtaggtctaatttttcctcatcatgaaattcttttcat
tgaggcggtggaaaagcaagattccttctcaatttagtaacaatcagtagaatgagagattttcatgatcatctcatacc
ttggagaaattcaatttctcaattttgttgcaattttgtttttctgtggctgactaggtaattgacaaagatcctacaaa
gaaggcaggggaattcgaagatgtatcagcagtggagaagtatgaaatggctacagaagattatgcaaaaagaactggtt
ggtttgaaatcctatattgttgattcctaagaaagtaaactttatagggcttcctatcaggaaaagtccttccgaacttt
tgcgtacaactcagcagtcatatctgtaatgatgatttcttgatgtaatggttgatgagttaatgatggcaaccatcatt
taacattgtttcatgcacaggtgcattaaacattacttcatcattctttcataaaagccatacaagtctgcctaattagt
atattgttagcttaattttatggtcttcctaccatgattgctttgtttaaattcttgtgaatgtgtagattctgttagag
cattcaaacaaagaaacaagatgggtcagtttaaagaaaaaaccccagaggaattacaacaagagaaagagcaagcccaa
aaggaagaagaagctgcaaaagccatcactgttgggtcaagatgcgaggtgacagttaaaaatgctccatgcaggcgggg
agtggtcatgtttgtaggtaaggtgtcttcccccatgtttggtgcacggtacacagataaaaaaacaacaacaacaacaa
atcttacagtgaaagtcgttcttgaatactttttacattggtcagtactcttgaggtgatgagcttagggctttgcgtaa
attaagccagagggaggtgagagtcaaatgaaaataacccttgttgctgtcatcatcatcatccttgctatcttcattgg
tatcatattgatgacaatgattcttattattagtactggaaggttgtatggctatcaccaaagggaaacactgggttcag
tatgttcactgaagttaagcactgttggacggggttgatatctggatgggtgaccatctagataaaataccctgtgccgt
actccttgggaagtcaggctggtgcagtggacatcaatcacgccttcctcctctactaaattgtagtatgtggattgagt
ttcagtcgatattaacctgtctttgagggttttctccaggcactccggtttcctccctcctcaaaattgactcctagtct
aatcaaatttgcaatttgcagggttatcctggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaatttcattatctgt
agggaaaaccgagttcaagtcaggatggtgggttggtgtgaagtatgatgaaccagttggaaagaatgatggaaggtagt
tacttgttcttgccaatatctctgaaactgcaactctcatttgtggttacagcaaatttaagagacttgacaattgactt
agaatataaaatagaaaacaataccatcactagatactacttaaggaaaacgtgaaggagaccttgacatggccaatctg
aaatagttttacggtaataattaagaggtatgatgtaacttagctcgacaatgtcttcgaattggaattctcgggattca
tagagtgacaataatcaaaggtgatattgagtatttgtgatttatctttcagtgttgcaggcaaaatgtacttctcttgt
ccaccaaaatacggcggattcgtaaaacccaaagatatctctgtgggagattttccagaagaagatcttggttttgagga
tgatgaaatgtaaattgttctacatatggaatattttgcgatatgagagatattgattttattagtccttcttagtagtt
attttaatctttcactcaaataaaataaaatattgaacagtttgctaagattaaagaatttgaaatcagtcagtttaaaa
aaggtcacagcattcctaaagtggagtttaaaactttccttgggcaattgctccacctcttagctacagaagaagggcat
gcatgagcattggattaggtttatatgggaattgtctggctctgctgcttgatcagaaattggtgagatattggaaatta
gtataaatttacttgtagtctatcgtgaatctgtgaatctgttggttatattactcatagactatctgctgaaagtctac
agttgtgaataggcaatgaaaatcggctattttgaacacgtgatgcttgtttcacacctcagtgcgcatcacgctcagtg
tttgaaacctttgaattaccgatgtaaacacaataaaacattttttcctaaacgttactttacatttttatgcgatgaga
ctatgagtaaatttatactaaaaacaattagactactcgccctcgtcttcaacgagcgatagtcaactcagctgtgcctc
gttgactatctgctcgtagaaaactcgcgcccgtagtctaattgttaagtagtagatttctcccttagattcattttgag
agggaccccttcaataatttatgttgttggggacaacagaaaaaagcagtgctctcagatgagagttcaactcatgtcag
agatgggccttgaattgtagctttttaagttgcatcaagtttaaaccagagtggcatcaaaccatggcagattgttagtt
tggatcctctgctactgaatccctttatcaataattgaaggggtgtgtggaataaggccttaagtgacttttgatgcaat
gtcaaattctcctagtcattcacaactgaatagaagaaaatttggaaggagaatctggtaatttatcagaagccacttaa
ggcttttctccaggcacccctgcaattattatgtctggggtataaaatttaccagtaacttaataaaacaatgccgcaaa
gtgtaccattggtcttacatgtgaagtgcctttttagaagggcctgcatacttttgtagaaagatcttggttgttcatca
tggtgaagtgtaatattatggtgttttgtctcacaaatgttttccattgtggtgcagattgaaacatttctattgcacat
ttctagtctagtgatggggtcaacattttggtgactagtttgtttgcagtggtcttgtattcagtgcttgtagaagggtt
attttggattcagggtgagcacaacttgtgggacatttcatcatgtaataatcacctgtttatcaggatgtatgaaactc
tgacgttaaggagaaggcccctgggacacatttggtccatttctttgtgtaattatatgaaacttagcaattcgttggtt
tgaagtcaattttgaaattttgcaccagtttcctccttaagcagctgttcagagttttataaatcacatgcgcatgtcag
aataataataacatttcattgattgtt

Protein
Protein IDaug_v2a.02365.t1
Definition-
>aug_v2a.02365.t1
MASFSTPSVVSVQISSSMTSFTAEKRLEKGETITSLKGRLELITGCSAMTMEVQLLDRDGKFLCILNNDSALFGAYPVED
NMRLHVIDKDPTKKAGEFEDVSAVEKYEMATEDYAKRTDSVRAFKQRNKMGQFKEKTPEELQQEKEQAQKEEEAAKAITV
GSRCEVTVKNAPCRRGVVMFVGKTEFKSGWWVGVKYDEPVGKNDGSVAGKMYFSCPPKYGGFVKPKDISVGDFPEEDLGF
EDDEM*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495