Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.02023
Locus scaf686 : 4083 ... 13405 : -
To GenomeBrowser scaf686:4083..13405
Genes list of scaffold scaf686

Manual annotation
Study fieldCell Cycle
Gene nameAdi-cdk1
DescriptionNamed thus because this protein shows similarity with Homo sapiens cyclin dependent kinase 1 by the BLASTP search. See Homo sapiens cdk1 (P06493).
mRNA evidence

Annotation by Blast2GO
Annotation GO
cyclin-dependent kinase 1 GO:0000083 GO:0000086 GO:0000088 GO:0000186 GO:0000187 GO:0000236 GO:0002755 GO:0004693 GO:0005524 GO:0005654 GO:0005739 GO:0005813 GO:0005829 GO:0005876 GO:0006260 GO:0006281 GO:0007077 GO:0007095 GO:0007098 GO:0007173 GO:0007265 GO:0007344 GO:0007411 GO:0008286 GO:0008353 GO:0008543 GO:0010038 GO:0014038 GO:0016020 GO:0016477 GO:0018105 GO:0018107 GO:0030496 GO:0030544 GO:0030855 GO:0031145 GO:0034134 GO:0034138 GO:0034142 GO:0034146 GO:0034162 GO:0034166 GO:0034501 GO:0035666 GO:0038095 GO:0038123 GO:0038124 GO:0042542 GO:0043066 GO:0043933 GO:0045995 GO:0048010 GO:0048011 GO:0048738 GO:0051276 GO:0051403 GO:0051437 GO:0051439 GO:0061061 GO:0070062 GO:0072686

Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.02023.t1 gi|156391793|ref|XP_001635734.1| predicted protein [Nematostella vectensis] 0.0
aug_v2a.02023.t1 gi|221127485|ref|XP_002162867.1| PREDICTED: cyclin-dependent kinase 1-like [Hydra vulgaris] 4.00001e-40
aug_v2a.02023.t1 gi|260838232|ref|XP_002613753.1| hypothetical protein BRAFLDRAFT_114825 [Branchiostoma floridae] 2.0e-39
aug_v2a.02023.t1 gi|557278728|ref|XP_006022416.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: cyclin-dependent kinase 1 [Alligator sinensis] 3.0e-39
aug_v2a.02023.t1 gi|548525438|ref|XP_005699118.1| PREDICTED: cyclin-dependent kinase 1 isoform X7 [Capra hircus] 3.0e-39

Transcript
Transcript IDaug_v2a.02023.t1
Definition-
>aug_v2a.02023.t1
ccctgtaaccagaaagtaagaaatcagaacaaaggcaaagactaccattgctgatggtggttttacccatcctggcttcc
ttaatttgaggttaggaacttctaagacgtggaacggtatcctgtacaatgcctccatttttcattgaacagcagagagg
actggagaggatactacaggtaatttgattggtccaacgcttcattgtattatccactgaaaaatgcgtttttattgaag
aaaacattagaccgtggaagactgaggtagaattaacactggtgtctgattggctaattcttcgggagccgcttttttca
aatacaaatcactcgacgtggtcattgcctctcatcctggaaagacgcttcaacaaggttagtgatctcttttttttctt
agagaagtgttccctgaaaggagtgacggatttctgataattgagtagaattcttgtatttcatgggtggttgttgttaa
aagagaggaggaggacaattttcttaaaaaacattcgaaagattcagttgttaagtgcaacgtcgtccgttaactattgt
tgttgttgaagatttaaccgaacaacaccaacggaccagtgaatttcgtatgctttttttttctgcctcaagcagcactg
gtttatccgattccacaccctaagtaaaatcaattttgttttaaactaatggcaaaaattaacagcttcctaccacgttc
cacctgcacaaaaacatgacatttatttgatttcatggcatgttccttctttcttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattgattggttttgtgtgagtatgtgnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnctaacggaactggtcgatgtcctgatttccaggtacatatggggtggtttacaaaggccgtaaca
aaaagaacaacaagttggttgctttgaaaaaaattcgtttggagctagctgaagaaggaataccaagtactgcagtgcga
gaaatttcgttgcttagggagctaagagagcacccaaatgtagtttcttggagcatattcttcatgatgatgcaaaattg
tatttggtatttgaatttctcatgtgtgacctgaaaaagcatttggattcaacaagggatgtgttggatagcatgctaat
caaggtaaagttaattgcattataaagattgaaaatggcagtactcaggatctgttttaccctttttggctctgcaaaat
ccataatactaaaaatttaatgaaaatagtattgtgttatatgaatcaagtatcttggcaaataaaaggcatattgttca
cacaagtaactaatgttcaggtttggtttctgttgcagagctacctttatcaaattacaaatgctatgtactattgtcac
agtcgtcgcatcttgcatcgagacttgaaaccacaaaacctgttaattgatgaacaaggacttgttaaattggctgattt
tgggcttggaagagcatttggcattcctgtcagggcatatactcatgaggtctgacaaccactaactttgaaacatgtaa
aagtcattaaagtttggtttgatattgttcttgtcagcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaaaataaacaattattgtgtaatcataatttccaaaaa
ctccttaaggacctttttttttccccaaagaatcctaggtactccgacagagaagaattggccaggagtgtcacagcttc
aagactataaaactgacttcccaagatggaatggagagggcctaaagaaagctgtcccacagatggatgaagtaggacta
gatttgctggaggtgaacacattatgtagaaactggagaataattatttgagtgcttgataataactctacagatatggt
gcacaaatgactatgaatcattcagtgtgatttttttgacagctcttgaaacaagttacttctttgtcttcctttcaaaa
ttagcattacttgtttatcatgtcattactaatttttttttttgtctcctgcagaaaatgctgatttacaatcctgccaa
gagaatatcagctaaagctgcacttgatcatccttattttaatgacttggatttgtcaactcttcctgcttccaaacaga
cagccattaaaggcaacatgctaagattcttctaaaagaattttagttcatgaatattaattttcttatttaatttgaat
cttgcagctttcaatttctgtcttgaacttattttaaacattagtatttctgtcagcttagaattatagctataactaat
gaaaataattatcataagttatagttataattattattacccaactcttcatgagttattttttattctttatgagttaa
ccacatcatctgaacacctggctggaattagcaccaatttgttagacgtctttccaatcaggtcataacattgttgacaa
ttttctttgcaaaattagtatggacactgtattttgattgagtctgaaataagtcatcatcaagctttaaatagttgcat
cttggtcaaagtgaatcacttgacttgctaaggctcaattagcagtattatttagttttaacttctgtaaatccaatgat
gaaattattatagcattcagagcaacattaaatcattggtaccaaatataattaccttgacctcaagacaacagttacaa
tttagtcattcctgttatagtaaaaaaatgtagacttcagttttataatattcaaaattgattgttctggctgttttgca
tgtttgctttgtgctggctttgtcttatcaagcacctaaattagacacttgaagattataatacacaatgcaatgacacg
tttgtttttattttcagaaagagcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnngggggaacaagcaccaggactaagtaagatgtctgctgtacaccttatgtctccatacacgacctaca
ttcctcgatacctgaaaatatggtggcccttggaaacgttccttgtctattcaggttgccaattctaccacgtttattag
tatgtagcagaaatgtaagcttcttatcaccttcgacctgcttccaaacgattgctatgcgcgattttcatcagacatcc
cgaggtagggcatgaaatgatctttattaagcttggtcacaacagagtgagtaggtgctgtttctatgcctgtaatgaca
ggaaaaactttttttttcaagtggatagaaaataccatcacttggaaaagaaaagaaaactccggaaacgtagaacggac
cagttacgagctagattacaggtaatttgcttcctattttttccttttaattttgaagtaaaacacagactccactctgc
agtctgtattttaaccttagactgcattttagcccagggttttacactgactacaatttgaagccactttatcttcaacc
catttctcaactccttcttccttaacttccaagaacagcagcagttgtcataaatgggtcgaggaataaaaatcaagaca
attcaatgactttgctctctggttaaatttggcatacgaaatcttgtgaatttcataccaaatgctcattgcaagcccca
acctgcagcaaagcacgcagaatttaatttttcgtagaagctgtcaagattattcgaaacttccagattaatttttttca
aatatgccagagaaaaatggttacttttcatattaatgtgacaaaatagaggaaaggaattttaccaggaaggaaggatg
tttatcagagtttgtacatttttgttgctataattttgcacaaagcttctcatagccagcaaacacttttttttcttgat
tttttggaagagattagatgaagaagatagacctactggctgtttgctctgtccaatgagaaatgacattgagataaatt
acaaggtgagttacaagtaccagtcttgtaagatgcaagtatgacttttctgaagtcatgtgtacaagagtataaggtgt
ttatttcagtgaagcattcaacatcattggcaaagattgaaggtactaagacaaaacaagagtgaagaaaaatgtcctgt
ctcttcccatggtattgctgtatgttttatcattttgttgttgttgtttttttcacacactagtttatctgattgaaaat
tacaccaaactaaggtgatgaagtagctaatgtgctcccaacaatatgtgaaagcacagtgaaaataaatttgtttgttt
ttgtttgtttttttctttttaatgcagaatgttcgtttgttgtcccaatttatttcaccacacacaggaaggatttatgg
aagaacattgacaggtcagtgctgttgcacaggacatgtctcataaaacaatgtaatgacacattaaaataatcctttat
ctcattttgtaggtttgtgtaataaaaagcaaacagaaatatcaggagccatcaggagagcaagggcgatgggtattaga
aaatattcaacactttcttcaacgagtcttctctatttcacactgactatttgggcttgtctttgtttgtttttggtagg
tttcatgcctgtgacaatgaagtatttggctttccatgatgaccccaagttattttagaagccttttgcaagaatttttg
ttttgtgtttcacctaaacttgagtttcgtaaagcaaataatgtaaataaagccacaccaattatacgttttctgtattt
ttgtacaaccaataatgcannnnntctaactttgttttacatgacaacagactgggacctggctttttatgatacatcta
tgagaaagatagcccctgcattcctggctccatttcttaaggaatgtcatctaaaaggaagtgattgccttctgaaaatg
gaggcaaatgggcttacatgggaaataaaataacaagcagacc

Protein
Protein IDaug_v2a.02023.t1
Definition-
>aug_v2a.02023.t1
MPPFFIEQQRGLERILQGAKRAPKCSFLEHILHDDAKLYLVFEFLMCDLKKHLDSTRDVLDSMLIKSYLYQITNAMYYCH
SRRILHRDLKPQNLLIDEQGLVKLADFGLGRAFGIPVRAYTHENPRYSDREELARSVTASRL*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495