Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.01302
Locus scaf508 : 18966 ... 24041 : +
To GenomeBrowser scaf508:18966..24041
Genes list of scaffold scaf508

Manual annotation
Study fieldAutophagy
Gene nameDRAM1

Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.01302.t1 gi|585693918|ref|XP_006821720.1| PREDICTED: DNA damage-regulated autophagy modulator protein 2-like [Saccoglossus kowalevskii] 2.0e-35
aug_v2a.01302.t1 gi|390358323|ref|XP_003729231.1| PREDICTED: DNA damage-regulated autophagy modulator protein 1 [Strongylocentrotus purpuratus] 3.0e-33
aug_v2a.01302.t1 gi|221123406|ref|XP_002154871.1| 3.0e-30

Transcript
Transcript IDaug_v2a.01302.t1
Definition-
>aug_v2a.01302.t1
attgcgccagtgcattgaaatgtttcacccaaactctacctctcccctccaactttttcacactttgaccatagtgtaaa
tagtaactatgctttgatagtgaaagttgaaacttgtggataatattcggcgtcaaaaaaggtttttttccaagcaagtc
aacaagacccagatccactcaagatcaagatccactcaagatccaaaaaaatgtgctgtttcacctcaaacactcgtcgc
tgcggactcgcctgtcttccgttgatactgatgttcctttccctttcaaccttcgttactacttacctaatatcctttta
ccgcgacgacacatcttggtttccaaccattagtgacacagcagataaatcaccagaaagcaatgttttcggccttctct
tcaatttctgtgccgcactttccttcttggtgattttctttcgataccttcaactgagacacgatgtagactggagtgaa
agcgacagacagcttcttttggttgtcaataaggtagccgtggcatttggcgccatttcaagctttggagcttgcattgt
ggccaattttcaggtaaaaagagctaggtaaagagccttagcaaggtagcttatatggctgcatgcatatcaaacaaagt
caaatcaatttgaaaatcttaagaaacctacgaggccccaacgaaaaaatggttcaatcgaacggttgattcgattgatt
agttaatgaaagtgtgggacagcaccatccacaggacaactctgttggttttggtagtcttatctgctggtccataatac
aatgcagcctttggacaacttcgaccaaaaggtagactattgcagtggtttgcaatttccgtgggacataaataagttga
gctgtatcacatctcttcagcagagaaaagcataaaaaattatacaaattcaaattcaatttgttgcagtactctgttgg
accatatctcctggtctccagatagagtctcaaatctcccagataatctcctacgtttgtcatttcttgtgatacttcct
tttatgtaagtggctaactatgagctgtttatttggtatacacctcgatcgaaggcaacaagattttgcacagacttgtc
atatgcattttgatgttccttccctgtcggtcctcaatagggagttcaagaagcaacaatggcagcagcaatgaaaacat
cacttgaaaatacacattcgggaataatcaataattggtgactatttaacaattgaaagggctacgggtcaatagcccat
gaggcgaagccaaatgttctattgatccatggcccttgagggcgaagcgtctaattgttttactatcacccaactagtcg
gacagaaaaaagcaataataaattcagcaacaaaaatatttatttgggaataaaaggaaataaataggtttacaaaaccg
gtgaacttcactactcgatgactattactaatagacctatagtagcgtagccaatcaaaatgcaggatttgcattagtcc
actagttgggtgatactatgtaacaattaggcccttgagggcgaagggtctatttgttttagtatcacccaactagtcgg
acagaaataaacagtaataaattcagcaaaaaaaaatatttatgtgggaataaaacaaaataaataggtttacaaaaccg
gcgaacttcgctactcaatgactgttactaatagaacgatagtagcatagccaatcaaaatgcagcattgcattagtcca
ctagttgggtgatactaattaacaatattattagactacgagcccaagttttctacgagcagatagtcaacaaggcacag
ccgagttgcctatcgctcatagaaaacgggggtgagtagtctaattattttagtataaatgtaccatagtctcatggcat
aaaaagaaaaaaatgtcaagtaacgggtagaaaaggactgtttcattacatcaggttcaaatgtggcgtgccacgtgtac
tgatgcacatagaaaaaggatcgtgtgcaactacattaccgtagactatcagcagatagtctacagtaatatagccaatc
agattcacgggcttataatagactatggtaaatttataccaatttttcttcctcacatcctttattgttgacaaagcatg
ctgcaaatggactggtagaagcatcaccgaaacaaatgtagagaatgaaagtttcaatgttctgtgttcacattgtcact
aaaaccttaaatttggaaatttcagttcattttatttggcagactttgtctaagattgtacttaaggacggtgcctacta
ttgttattgcggatacgttctgcgcatctccagatactcagacttcttattgccaatgcttactaatacagggatatttt
tgcgcgttttgaaactatccagagaaagtaaatcttagtaagtactcttggtatccaaaaagaaaattgggggtgaccat
gcatttttgagagataattaagcttcaatttgagaaagaacgctatatattgctctgtatgtgaaagctttttacagata
ttattcatgaattatctttgaaaaatgcgtggttacacccaattttctttttggacttcaataggacttgttaagatcta
catttcctgcataattacacaccggggaaacattatccttaattagtaggcaccgtccttaagtgcttgccacaaatgca
gcacaattatttttcatcattcaaccaatcagatctttgttatttggtgctgtcattgccgttgccattgtccaaggttg
cttaaattccctaatacttaaagacttacagggttgacagccttggtactgatcatcatccaacatcatcatcgccgtta
atgacagtaataaaataatgtatagtaatccatcttccttgtttgcaaacattgatgtcacagtaaagaataatattgat
attcgtttgacaattcaacattttcaaccattttttacaatgggtgatattttgagaaatcttgtgatattgatattaaa
gcaatactattcgcagacatctatcaaaggcaataataataatattgattgtttcttcttggcatttttcaaagtactga
agttactgcctcttctttgtgctaaaaatgcaaaaaaatgtgaaacattatgtacagtgaaaatgctcttgaaatccttt
tgataataactattgattaataaattcttgcaggaagataaagtcattggagttcacataacaggtgcaggaatggtgtt
tatcggtggcattttctactgctggatccagtcttttatttcttacaagatgaagtcttgtggtctcatcaccccaatgc
ttttgatgctaagagtcatcttggccattttgatgtcattgttcttcatttcttgtgtcactgctttattctatgcaggc
aaagaatggtttagctacctcaaacacacaacacgtgccccccaccagcataaatggagccccaaggaggagcattatct
ctaccacgtggttggtgatgtgtcagagtggctaatggctttaacgctgttgggcttcatggcaacattttttggtgagt
tcagattcgtgaagatgaaaatcatggtttccagatgcacacagaatccagtaccacttgggggtaatgcaggctctgat
gaagggctgtattcttccctgtatgtctagttcattattttaagagttctaatagcagggctcaaaaatgtgaataatgc
aactgtaaaagctactaacttttgcagttttgtgacttaaaatattttttatagtcatgacaatgaaagactatactttt
tggggcaggttagttaaatatctaacccttatcatgctgctgcagccgctattttagatttgaaacaaggctggacagga
ataaacaatgtacttaaaatatattatgcattctaaagacagtgtgcacattctttatgcctgtccagccttgtttcaaa
tccgaaatggcagttactgtacatgataatggtctattgtgtgacaaagctgttcagctttgtctgtctactaatgccag
tcatcaagtaaaaattgatattacaatccactctctaagccccttagtgtggtttcaattcaagagttatagttagggcg
ttgactgtgcccatctttgatcagttcaatttgattttttgtggtttagtttgagttctagtctcgtcaatatttttttt
ggattggctgatcattttccctcaactaagatcctcaaaaaaagttatcgtcattctcattagagcggttttcaaatgac
tgtcgaaaaatcaaaaccaaagcaattactccaaaccaatcacaacaggagcagacagcgcgatgaaccaatcacaattc
ctagcaattacatgtaactcgctcaaagtgcaggaaaaatcacgcgtacatggtgcggttggttttggttttgcttctca
ttggttgaaaaactgacgcgagtcttttaagccaatcactaagcgtagcaatcgcaatcacgtaattactttcgacagtc
atttgaaaactgctctactttgcatatagaagtcttgcaaatgattagattattgttgttaatgttaggtccccttttta
cttaaactttgctgataaacctttaaatggcagcaacataaggaagttgtaagaaatagtgtagaggttgtttaattata
aggttttttttttttacaagatgaagagttaggccaaagttatgaagttcaggttgagacaaatacaacctagttttatt
gtttgctggctgtagctaatgtaatttattatatcttgccgatcaaattattcttaagttctttggtgttagtatgcatc
tgaaaatgcatttgcatggccaggaaagctgtattaaagatgccatgtttgtagcttagttggagtttttaagagtgttt
ctgtaaaggagctgtcattcaatggcagctcattactgttgaacatggcacttcgacagaatgtaaccttgttgtagcta
tgtctattggatcattaaatgatactctttcctgtt

Protein
Protein IDaug_v2a.01302.t1
Definition-
>aug_v2a.01302.t1
MCCFTSNTRRCGLACLPLILMFLSLSTFVTTYLISFYRDDTSWFPTISDTADKSPESNVFGLLFNFCAALSFLVIFFRYL
QLRHDVDWSESDRQLLLVVNKVAVAFGAISSFGACIVANFQEDKVIGVHITGAGMVFIGGIFYCWIQSFISYKMKSCGLI
TPMLLMLRVILAILMSLFFISCVTALFYAGKEWFSYLKHTTRAPHQHKWSPKEEHYLYHVVGDVSEWLMALTLLGFMATF
FGEFRFVKMKIMVSRCTQNPVPLGGNAGSDEGLYSSLYV*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495