Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.00529
Locus scaf241 : 772 ... 8875 : -
To GenomeBrowser scaf241:772..8875
Genes list of scaffold scaf241

Manual annotation
Study fieldPhotoreceptors / Circadian
Gene nameAdi-opsin-9

Transcript
Transcript IDaug_v2a.00529.t1
Definition-
>aug_v2a.00529.t1
caaccaattttcctgaggaaaacgcaaaaaaagggaaacctcgctcatgtggtagaacggggaaattcctcgctggatta
gcacaaaggctgtgcgttaggatttaaaacccgtatcaagtttgaattgtcaaacgggtaagtgtcaggacgcctaatgt
tttacagcactggagaccatattcctgatgggtcaagatatgataaattcgaatcgacgagatatacaaaatacgcaacc
tgtttgatttttcgtgtattattgtgatgttgactgtttaaatttactttgtgagtgttgccaaagtgtgcagatcattc
tagctgaattaggatcgattagttcaaccttgtgtgaagatatcagatatcaagaatcacttggttcaaaaatactttac
ctcgaagaaaaaaaaaatgttcatttgcaaactctgatggagtggcaattaattacatcctgtatctttcgaagctctta
ttgctgtaaaggttaccacaagatcgatcgagctacctgcatattagacttatctacccatagttcattcatgttctttt
aatatctgcgttccttaaccttttattcttaagtgtcgttgaagaagcattgtgtcgaagctcgtcaatggaaaagtctc
ttgcacggcattatcacgacttagtttacaattcaacaaggcggtgaattcttaaaagggtttaatgaactcgggtgctg
taaaaataaaaaaaaactgaaattatactatgtcacagagcttcttcctcagtattagaaaaggcttatagaaaaaaaat
cagattccgtgttttatttgcaaaatttaattctctttgcctcaacctattcatggtcgagcttaatttttgcacacgtg
caataccacttcgttgtgtgaacttcaggaacggcccatgcgttcataagatttatcgtcagagattagtccgcccgcct
atttcgcttcttgttcaggttgtttagactaaaattatcaaataaaacaaggaaggaccgctgaactttgaagtaatgct
ggattctgtttgtttttggccttaaaatttattcgttagatttcttttaatcgacttatttcttgcagtgtgacgtgcat
ttgattttgcttaatgtctttttttgactttttggacaactttgatgactgatgctttctcttaacgaaatatctggttg
agccaaacgctctttcatttctcttaatacggaagtgtttgttgttgcgttagtatgaaattgcttgtcgaatcatattt
gtcgtcatgtttcatgaatttgcctttcttcaaagaccaacaaaaaaatacaagactaaggtcattacacaacgatttct
gttctttacagtaattttagtttgaatcaaaattgtttctttgctgcgtatgacgacaggcctagcaccaaatccctagc
tttactaaagcgatgatatgttagccatcaatttcttttgacattctttccgccaaaacgttgtttcttcttttcggttt
atatttgcaacatcaaaatcttgttccagaagagaaaaaaaaaattaccacctgtgacgcaacctcattgtgttattttt
tgctttcactgttatctaatttgttttgcgtttgtattcacaataacaaaaatgtcatggctcttggcttctccaaatcc
ttccaagttattgtttttcttgttagcagtactgtgattgaaagtatacaaaaggagataaatgaatgtaaatcaaagtg
acaaaacaaattttaccggtgacccactcaaaaggataatcagaacgataattgtaaatatgaaaagaccagcagataaa
actggtgaccctgtctttgtgacacctagttcaatggctgatctcccatggtcctccagcagcttggtggttctatccaa
actgacgcttcgacttgtgttcggagccttgaatttttccgagtttgcccgagacataatctattcgcacacctcttcag
tgagttacaaggtgtttttttcactgtgcagcgagtcaatatgaattccgaggacctgtttaacttggtttttgcagtaa
cgaggagctgcgtaggccttcataatcattaattgtccgtttcgtttaaaaatgtgtatttcgtttattttgagcacaaa
gaatcgatttgtcgaagaatttcgataatatttagagcacttcagaacgtcattgaaatacctgtcctgacttttaactc
tgttaaagagaaaaatggcgttcacctcaggtatatgttttatgtggcaaaatcttgtcacgatcaggtcgtaaatatgc
cgtttatgtgttattttgctttttttctgtagtatacacagtcgcaattgttgtgttgacatggttgattgcgctcaggg
gtgtggcaaggtcgggtggtcttgggctcgggtagagtcctatttaagcctgtgttttcccttaggcttaagtgccaagt
ttcagcttaattaagcaatgtccagcattccttttggaaaggcgttatcccagccctcgacctcgaagaatgcgacttcc
ctgaaccataattgtctggtatcattggaaatcaatccattcactgttgcttaactgctattttctttcttaggttgccg
ctactcaattatgggttttggttttttatttttattaatatcgtttgtaccactatccaaagcgaaaggtgagtgtgtca
tgtggctgatttaaaaaaaaaaaacaaaaacaaaagtttttactgcttgctaaccgcagaagatatattccttaaaaagt
tgcttcaaatttcccactcgaatgcctcataggtaatcattagtcatgcaatgcaacttcgtcgcggaatctaacgactc
atgcgttcataaaattcagttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnttggttcctaagccaggacctggttagtagtactgtatttcccttcattcttgaagataca
gatttacaaacagttatcgttgtccatctggctccagtggttcaaagtatctagaggataaatcaattggttttgatagt
atttttctcaaattcatttataattcgtgaaattgctaccgtgaagtaggtttggatatgtgatccttattctcaaaaaa
ttctgtaaacttttgctttgagtttctctaacaattattaatgctttgagaagctatcaaacactcgaaaaagtgtttta
ttagatatccaaacacttcgaagttggttgaaaaaaactcggctgcgcctcgttttttcaacccttttctcagtgtttgg
atatctgatgaaacattctttcctcgtgtttgatatattacatcgattggatagctgtatccgtccttagaacacctggg
ccctgtacacgggcgactgcttgaggcttataacactacaacataaggcaattttaatcagatgcgtgccgcatagccgc
attgtataaataaaaatgcttgcatgcgacgacaaattccgacagtcctaagcattttttttattaccgtttttactgta
actgcatgactgttctaggaaaggatcaacaatccgctaagaaatcagttgttcctgagtttagtgaagccggtgggctg
cgaccgctgagcgtaaaccttcccgaacagcagcaaccagactcaaaaaaccctcaaggctatgttcagccccagacttc
ggcacttagtccagaccaagtaccctacgcggaccaagctgcagctggaagcatggcccctaccaatgaacaatcctttt
ccccagttcccgcagcatctcagtctcaggtttacgcccaggcccctgaacagagtcctcaacaagcgctcgatcaggtc
caaggcggtggtctccaggctactgaacagcctctttattcacaagaggcggtaccatcaaatatgcaagcaccaggatt
ccaaaatacaactgcagcatttcccacgagtgagtggtgttgcaccagatttaaactgacaaataatacggtgttatttt
agcattgcaaaaatccatcagtcaagttcttctttgttcagtaaccaataatatttgtcaacagatgcgtcaatgaacaa
cgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccttttcgcgtacttctaaacgtcggc
attgatccaaactttccacaaaaaagttttttgtttctcttttggccttattcagagaaaaaaatttcgctttccggcta
aaacatttttagcttagcaacgcttagcgcaatcatttaccatataaggtcaaactaaggtatatgagctgataaccaag
attgagcgaaccaatcagagtacgtgaaatgcattatccgaggttaagaatttaataaagtgatttattcaactcgttct
cgtcagttcataccatcaaattatagaattttagttgctgtgaatttggtttctactttgcacttgatttgatacataca
accatagcaacagtcaccataattcttcttcctccattttcttattcagagatcaagaaaaatgatgaggcatctggctc
aggcgagtatgaagaatcaggttccgccacgagactgtattatgctgacgaggtttctggatctggctccagtgaccatg
cagaagatgacgacgatagttatg

Protein
Protein IDaug_v2a.00529.t1
Definition-
>aug_v2a.00529.t1
MGFGFLFLLISFVPLSKAKGKDQQSAKKSVVPEFSEAGGLRPLSVNLPEQQQPDSKNPQGYVQPQTSALSPDQVPYADQA
AAGSMAPTNEQSFSPVPAASQSQVYAQAPEQSPQQALDQVQGGGLQATEQPLYSQEAVPSNMQAPGFQNTTAAFPTKIKK
NDEASGSGEYEESGSATRLYYADEVSGSGSSDHAEDDDDSY

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495