Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.00192 |
|---|---|
| Locus | scaf85 : 26624 ... 44065 : - |
| To GenomeBrowser | scaf85:26624..44065 |
| Genes list of scaffold | scaf85 |
Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.00192.t1 | gi|701323124|ref|XP_009990659.1| | PREDICTED: probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, partial [Tauraco erythrolophus] | 0.0 |
| aug_v2a.00192.t1 | gi|564231470|ref|XP_006260129.1| | PREDICTED: probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 [Alligator mississippiensis] | 0.0 |
| aug_v2a.00192.t1 | gi|556966145|ref|XP_005992511.1| | PREDICTED: probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, partial [Latimeria chalumnae] | 0.0 |
| aug_v2a.00192.t1 | gi|557284034|ref|XP_006024872.1| | PREDICTED: probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 isoform X1 [Alligator sinensis] | 0.0 |
| aug_v2a.00192.t1 | gi|683928638|ref|XP_009094239.1| | PREDICTED: probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 isoform X3 [Serinus canaria] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.00192.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.00192.t1 tacatggagcgctgaaatacaatcagatacctttttcttgtaaaagtagtgatgttttgttggggaaagatagatgatga accctggcttgccccgaaaaatgtggaggattgtttctgcgcactttccgaaattaaagacatcgcttgtggttggaagc atacagcagtgttaaaaaacgacggagttatatgtacctgcggaagtaatgaaaatggacagcttggacatcataannnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggttggattatgttac gtcatggtgaatgtcgttggtttgaaactgttctcttcataaggagataacagttatgtgacctgtgtaaatgctacatg 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Protein
| Protein ID | aug_v2a.00192.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.00192.t1 MFCWGKIDDEPWLAPKNVEDCFCALSEIKDIACGWKHTAVLKNDGVICTCGTHVDSLETRTVTQVACGEMHTLAVTDDGL VFSWGNNTKGQLGIGNPDNTVQRHPRVVKHLQTNGFMITQAACGAKHSLVLATNGFLFAWGDNKYGQLGIGHSSSVHYIP EHVSSLVGVPFAQICAGGHHCFSLSLSGALFGWGRNNFGQLGVNDDKDHIVPILVKSLRTQRVRHVTAGEYHSAVLTEDG GVFTFGRGSYGQLGHNSNHDEYNPRKVFELMGKVVTQIACGRNHTLAYVAASGQLYSFGGGDSGQLGNNQVASVNSPVLV QKSWVSRTSKGNNMPRVIRQIAAGGDQCYVLTAAKDNSLAPRDFRKPDTSKQLWTLSESKEFFLLLLTEILDPKYGMFTY IDESRTIWFNDLTFEENPMFLLIGVICGLAIYNSTIIDLRFPPVLYKKLLRRKPTLDDFRGFKPSVARNLQYLLDYPEDE DVVEAFGLNFQEYVDLYIDYYLNKSVEKQFQAFATGFHRVCGGKVLEFFHPEELMQMVVGCQDYDFRELEKIIIQPVAGG KLGDHLPVAHTCFNLLDLPRYATKDLLKNKLSQAVEYSTGFGLA* |
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