Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.00084 |
|---|---|
| Locus | scaf42 : 3372 ... 13235 : - |
| To GenomeBrowser | scaf42:3372..13235 |
| Genes list of scaffold | scaf42 |
Manual annotation
| Study field | Autophagy |
|---|---|
| Gene name | ATG6-1 |
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| beclin-1 isoform x2 | GO:0000045 GO:0000407 GO:0000910 GO:0001666 GO:0005634 GO:0005739 GO:0005768 GO:0005783 GO:0005802 GO:0006968 GO:0006995 GO:0007040 GO:0008285 GO:0016032 GO:0016239 GO:0019898 GO:0030425 GO:0032258 GO:0033197 GO:0034271 GO:0034272 GO:0042493 GO:0043066 GO:0043548 GO:0044804 GO:0045324 GO:0045335 GO:0048666 GO:0050435 GO:0050790 GO:0051607 GO:0071275 GO:0071364 GO:1903599 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.00084.t1 | gi|731240919|ref|XP_010633834.1| | PREDICTED: beclin-1 isoform X3 [Fukomys damarensis] | 0.0 |
| aug_v2a.00084.t1 | gi|512940122|ref|XP_004909063.1| | 0.0 | |
| aug_v2a.00084.t1 | gi|1008840|gb|AAB59573.1| | partial ORF; putative, partial [Homo sapiens] | 0.0 |
| aug_v2a.00084.t1 | gi|146332593|gb|ABQ22802.1| | beclin 1-like protein [Callithrix jacchus] | 0.0 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.00084.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.00084.t1 tcaagagaagatttggcatgggtcggtgctgaccatacacgccattgcaatcgctaaaattggtaaacatggcttccggg aaagaaactcgtacagcgcttgttagttttgtatgccaaagatgctaccaacccttgagattagacatgtctttgttgtc tatggatggagaagcgctagcagaattggcaggtgagtagaataaatagagaatgtgttaacattatgcgctgacctact cgaatcaatcttatgcttgtttcgattcaccaccgttttccttaaatgaagttattgttacgtactttagagcctttccc aggatttgaacctgactctagcggtggacaagatacagagagacacgatacaagtatacacgaggtgattaaatggagaa tgatacgtggacgcgctgagatagggaatttctcttccagtgttcaactcgataactctgtgagatatcgagttgaacac gagtttatgatacaaacactttactaacaacaagaagttgagtttttttcacatttcagaaaagagaacgctttgctatt cattcagggtacttaattgcgtgagagacgtgttagcggctgaatggctatctcaaagacacaattgtcgtaatttactg tatgacttgttggggtacagtttttttcagtggtggaaatccttgtaaaggacgccagtttatagtataataaacattaa tatttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttatttaagtgtctagtcattctagcactaaagtactaattgaaggggtg tgtggaataaggccttatgatgcaatgtcaaattctcctagtcattcaactgtatacaaggaaatttgcaaggagaatct ggtaatttatcagaagtcacttaaggcttttctccaggcacccctgcaattgggaacactgtaaactcaaattaacaatt 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|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.00084.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.00084.t1 MASGKETRTALVSFVCQRCYQPLRLDMSLLSMDGEALAELAEPFPGFEPDSSGGQDTERHDTSIHETPTNLEEDDTVVRR KIAPPSVENQMRYAQAQLDKLKKTNVFNSTFHIWHKGHFGTINNFRLGRLPSVPVEWSEINAAWGQTVLLLHSLARKMNL TFERYRLVPFGNHSYLESLADKSKDLPL* |
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